Ver registro no DEDALUS
Exportar registro bibliográfico

Metrics


Metrics:

High-throughput sequencing of a South American Amerindian (2013)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA DE - FMRP ; SILVA JUNIOR, WILSON ARAÚJO DA - FMRP
  • USP Schools: FMRP; FMRP
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0083340
  • Subjects: GENÉTICA DE POPULAÇÕES; GRUPOS INDÍGENAS; SUL-AMERICANOS; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO; VARIAÇÃO GENÉTICA
  • Language: Inglês
  • Imprenta:
  • Source:
    • Título do periódico: PLOS ONE
    • ISSN: 1932-6203
    • Volume/Número/Paginação/Ano: v. 8, n. 2, p. E83340-1 - E83340-8, 2013
  • Acesso online ao documento

    Online accessDOI or search this record in
    Informações sobre o DOI: 10.1371/journal.pone.0083340 (Fonte: oaDOI API)
    • Este periódico é de acesso aberto
    • Este artigo é de acesso aberto
    • URL de acesso aberto
    • Cor do Acesso Aberto: gold
    • Licença: cc-by
    Informações sobre o Citescore
  • Título: PLoS ONE

    ISSN: 1932-6203

    Citescore - 2017: 3.01

    SJR - 2017: 1.164

    SNIP - 2017: 1.111


  • Exemplares físicos disponíveis nas Bibliotecas da USP
    BibliotecaCód. de barrasNúm. de chamada
    FMRP2479664pcd 2479674 Estantes Deslizantes
    How to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      RIBEIRO-DOS-SANTOS, André M.; SOUZA, Jorge Estefano Santana de; ALMEIDA, Renan; et al. High-throughput sequencing of a South American Amerindian. PLOS ONE, San Francisco, v. 8, n. 2, p. E83340-1 - E83340-8, 2013. Disponível em: < http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0083340 > DOI: 10.1371/journal.pone.0083340.
    • APA

      Ribeiro-dos-Santos, A. M., Souza, J. E. S. de, Almeida, R., Alencar, D. O., Barbosa, M. S., Gusmão, L., et al. (2013). High-throughput sequencing of a South American Amerindian. PLOS ONE, 8( 2), E83340-1 - E83340-8. doi:10.1371/journal.pone.0083340
    • NLM

      Ribeiro-dos-Santos AM, Souza JES de, Almeida R, Alencar DO, Barbosa MS, Gusmão L, Silva Júnior WA da, Souza SJ de, Silva A, Ribeiro-dos-Santos A, Darnet S, Santos S. High-throughput sequencing of a South American Amerindian [Internet]. PLOS ONE. 2013 ; 8( 2): E83340-1 - E83340-8.Available from: http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0083340
    • Vancouver

      Ribeiro-dos-Santos AM, Souza JES de, Almeida R, Alencar DO, Barbosa MS, Gusmão L, Silva Júnior WA da, Souza SJ de, Silva A, Ribeiro-dos-Santos A, Darnet S, Santos S. High-throughput sequencing of a South American Amerindian [Internet]. PLOS ONE. 2013 ; 8( 2): E83340-1 - E83340-8.Available from: http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0083340

    Referências citadas na obra
    Autor: DR Bentley
    Título: Accurate whole human genome sequencing using reversible terminator chemistry
    Título do periódico: Nature
    Volume: 456
    Primeira página: 53
    Ano: 2008
    DOI: 10.1038/nature07517
    Autor: M Margulies
    Título: Genome sequencing in microfabricated high-density picolitre reactors
    Título do periódico: Nature
    Volume: 437
    Primeira página: 376
    Ano: 2005
    Autor: KJ McKernan
    Título: Sequence and structural variation in a human genome uncovered by short-read, massively parallel ligation sequencing using two-base encoding
    Título do periódico: Genome Res
    Volume: 19
    Primeira página: 1527
    Ano: 2009
    DOI: 10.1101/gr.091868.109
    Autor: RA Gibbs
    Título: The International HapMap Project
    Título do periódico: Nature
    Volume: 426
    Primeira página: 789
    Ano: 2003
    DOI: 10.1038/nature02168
    Título: A map of human genome variation from population-scale sequencing
    Título do periódico: Nature
    Volume: 467
    Primeira página: 1061
    Ano: 2010
    DOI: 10.1038/nature09534
    Autor: SM Ahn
    Título: The first Korean genome sequence and analysis: full genome sequencing for a socio-ethnic group
    Título do periódico: Genome
    Volume: 19
    Primeira página: 1622
    Ano: 2009
    DOI: 10.1101/gr.092197.109
    Autor: J-I Kim
    Título: A highly annotated whole-genome sequence of a Korean individual
    Título do periódico: Nature
    Volume: 460
    Primeira página: 1011
    Ano: 2009
    Autor: P Tong
    Título: Sequencing and analysis of an Irish human genome
    Título do periódico: Genome Biol
    Volume: 11
    Primeira página: R91
    Ano: 2010
    DOI: 10.1186/gb-2010-11-9-r91
    Autor: SC Schuster
    Título: Complete Khoisan and Bantu genomes from southern Africa
    Título do periódico: Nature
    Volume: 463
    Primeira página: 943
    Ano: 2010
    DOI: 10.1038/nature08795
    Autor: B Shapiro
    Título: Analysis of ancient human genomes
    Título do periódico: BioEssays
    Volume: 32
    Primeira página: 388
    Ano: 2010
    DOI: 10.1002/bies.201000026
    Autor: A Fujimoto
    Título: Whole-genome sequencing and comprehensive variant analysis of a Japanese individual using massively parallel sequencing
    Título do periódico: Nat Genet
    Volume: 42
    Primeira página: 931
    Ano: 2010
    DOI: 10.1038/ng.691
    Autor: M Rasmussen
    Título: An Aboriginal Australian genome reveals separate human dispersals into Asia
    Título do periódico: Science
    Volume: 334
    Primeira página: 94
    Ano: 2011
    DOI: 10.1126/science.1211177
    Autor: A Patowary
    Título: Systematic analysis and functional annotation of variations in the genome of an Indian individual
    Título do periódico: Hum Mutat
    Volume: 33
    Primeira página: 1133
    Ano: 2012
    DOI: 10.1002/humu.22091
    Autor: R Gupta
    Título: Sequencing and analysis of a South Asian-Indian personal genome
    Título do periódico: BMC Genomics
    Volume: 13
    Primeira página: 440
    Ano: 2012
    DOI: 10.1186/1471-2164-13-440
    Autor: J Wang
    Título: The diploid genome sequence of an Asian individual
    Título do periódico: Nature
    Volume: 456
    Primeira página: 60
    Ano: 2008
    DOI: 10.1038/nature07484
    Autor: C Gonzaga-Jauregui
    Título: Human Genome Sequencing in Health and Disease
    Título do periódico: Annu Rev Med
    Volume: 63
    Primeira página: 35
    Ano: 2012
    DOI: 10.1146/annurev-med-051010-162644
    Autor: HA Burbano
    Título: Targeted investigation of the Neandertal genome by array-based sequence capture
    Título do periódico: Science
    Volume: 328
    Primeira página: 723
    Ano: 2010
    DOI: 10.1126/science.1188046
    Autor: NJR Fagundes
    Título: A reevaluation of the Native American mtDNA genome diversity and its bearing on the models of early colonization of Beringia
    Título do periódico: PLoS One
    Volume: 3
    Primeira página: e3157
    Ano: 2008
    DOI: 10.1371/journal.pone.0003157
    Autor: RE Green
    Título: A draft sequence of the Neandertal genome
    Título do periódico: Science
    Volume: 328
    Primeira página: 710
    Ano: 2010
    DOI: 10.1126/science.1188021
    Autor: DH O'Rourke
    Título: The human genetic history of the Americas: the final frontier
    Título do periódico: Curr Biol
    Volume: 20
    Primeira página: R202
    Ano: 2010
    DOI: 10.1016/j.cub.2009.11.051
    Autor: P Forster
    Título: Origin and evolution of Native American mtDNA variation: a reappraisal
    Título do periódico: Am J Hum Genet
    Volume: 59
    Primeira página: 935
    Ano: 1996
    Autor: F Rothhammer
    Título: The late Pleistocene colonization of South America: An interdisciplinary perspective
    Título do periódico: Ann Hum Genet
    Volume: 73
    Primeira página: 540
    Ano: 2009
    DOI: 10.1111/j.1469-1809.2009.00537.x
    Autor: D Reich
    Título: Reconstructing Native American population history
    Título do periódico: Nature
    Volume: 488
    Primeira página: 370
    Ano: 2012
    DOI: 10.1038/nature11258
    Autor: R Bisso-Machado
    Título: Uniparental genetic markers in South Amerindians
    Título do periódico: Genet Mol Biol
    Volume: 35
    Primeira página: 365
    Ano: 2012
    DOI: 10.1590/S1415-47572012005000027
    Autor: WA Silva Jr
    Título: Mitochondrial Genome Diversity of Native Americans Supports a Single Early Entry of Founder Populations into America
    Título do periódico: Am J Hum Genet
    Volume: 71
    Primeira página: 187
    Ano: 2002
    DOI: 10.1086/341358
    Autor: M Van Oven
    Título: Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation
    Título do periódico: Hum Mutat
    Volume: 30
    Primeira página: E386
    Ano: 2009
    DOI: 10.1002/humu.20921
    Autor: DG Smith
    Título: Distribution of mtDNA haplogroup X among Native North Americans
    Título do periódico: Am J Phys Anthropol
    Volume: 110
    Primeira página: 271
    Ano: 1999
    DOI: 10.1002/(SICI)1096-8644(199911)110:3<271::AID-AJPA2>3.0.CO;2-C
    Autor: Q-P Kong
    Título: Updating the East Asian mtDNA phylogeny: a prerequisite for the identification of pathogenic mutations
    Título do periódico: Hum Mol Genet
    Volume: 15
    Primeira página: 2076
    Ano: 2006
    DOI: 10.1093/hmg/ddl130
    Autor: EB Starikovskaya
    Título: Mitochondrial DNA diversity in indigenous populations of the southern extent of Siberia, and the origins of Native American haplogroups
    Título do periódico: Ann Hum Genet
    Volume: 69
    Primeira página: 67
    Ano: 2005
    DOI: 10.1046/j.1529-8817.2003.00127.x
    Autor: AKC Ribeiro-Dos-Santos
    Título: Heterogeneity of mitochondrial DNA haplotypes in Pre-Columbian natives of the Amazon region
    Título do periódico: Am J Phys Anthropol
    Volume: 101
    Primeira página: 29
    Ano: 1996
    DOI: 10.1002/(SICI)1096-8644(199609)101:1<29::AID-AJPA3>3.0.CO;2-8
    Autor: TM Karafet
    Título: New binary polymorphisms reshape and increase resolution of the human Y chromosomal haplogroup tree
    Título do periódico: Genome Res
    Volume: 18
    Primeira página: 830
    Ano: 2008
    DOI: 10.1101/gr.7172008
    Autor: SE Santos
    Título: Multiple founder haplotypes of mitochondrial DNA in Amerindians revealed by RFLP and sequencing
    Título do periódico: Ann Hum Genet
    Volume: 60
    Primeira página: 305
    Ano: 1996
    DOI: 10.1111/j.1469-1809.1996.tb01194.x
    Autor: LA Rodriguez-Delfin
    Título: Genetic diversity in an Andean population from Peru and regional migration patterns of Amerindians in South America: data from Y chromosome and mitochondrial DNA
    Título do periódico: Hum Hered
    Volume: 51
    Primeira página: 97
    Ano: 2001
    DOI: 10.1159/000022964
    Autor: SL Zegura
    Título: High-resolution SNPs and microsatellite haplotypes point to a single, recent entry of Native American Y chromosomes into the Americas
    Título do periódico: Mol Biol Evol
    Volume: 21
    Primeira página: 164
    Ano: 2004
    DOI: 10.1093/molbev/msh009
    Autor: L Roewer
    Título: Continent-wide decoupling of Y-chromosomal genetic variation from language and geography in native South Americans
    Título do periódico: PLoS Genet
    Volume: 9
    Primeira página: e1003460
    Ano: 2013
    DOI: 10.1371/journal.pgen.1003460
    Autor: G Bailliet
    Título: Brief communication: Restricted geographic distribution for Y-Q* paragroup in South America
    Título do periódico: Am J Phys Anthropol
    Volume: 140
    Primeira página: 578
    Ano: 2009
    DOI: 10.1002/ajpa.21133
    Autor: U Toscanini
    Título: Male lineages in South American native groups: evidence of M19 traveling south
    Título do periódico: Am J Phys Anthropol
    Volume: 146
    Primeira página: 188
    Ano: 2011
    DOI: 10.1002/ajpa.21562
    Autor: MC Bortolini
    Título: Y-chromosome evidence for differing ancient demographic histories in the Americas
    Título do periódico: Am J Hum Genet
    Volume: 73
    Primeira página: 524
    Ano: 2003
    DOI: 10.1086/377588
    Autor: DA Demarchi
    Título: Genetic structure and gene flow in Gran Chaco populations of Argentina: evidence from Y-chromosome markers
    Título do periódico: Hum Biol
    Volume: 76
    Primeira página: 413
    Ano: 2004
    DOI: 10.1353/hub.2004.0043
    Autor: A Sala
    Título: Genetic analysis of six communities of Mbyá-Guaraní inhabiting northeastern Argentina by means of nuclear and mitochondrial polymorphic markers
    Título do periódico: Hum Biol
    Volume: 82
    Primeira página: 433
    Ano: 2010
    DOI: 10.3378/027.082.0406
    Autor: A Blanco-Verea
    Título: Y-chromosome lineages in native South American population
    Título do periódico: Forensic Sci Int Genet
    Volume: 4
    Primeira página: 187
    Ano: 2010
    DOI: 10.1016/j.fsigen.2009.08.008
    Autor: SEB Dos Santos
    Título: Differential contribution of indigenous men and women to the formation of an urban population in the Amazon region as revealed by mtDNA and Y-DNA
    Título do periódico: Am J Phys Anthropol
    Volume: 109
    Primeira página: 175
    Ano: 1999
    DOI: 10.1002/(SICI)1096-8644(199906)109:2<175::AID-AJPA3>3.0.CO;2-#
    Autor: VF Gonçalves
    Título: Identification of Polynesian mtDNA haplogroups in remains of Botocudo Amerindians from Brazil
    Título do periódico: Proc Natl Acad Sci U S A
    Volume: 110
    Primeira página: 6465
    Ano: 2013
    DOI: 10.1073/pnas.1217905110
    Autor: M Balter
    Título: Archaeology. Ancient algae suggest sea route for first Americans
    Título do periódico: Science
    Volume: 320
    Primeira página: 729
    Ano: 2008
    DOI: 10.1126/science.320.5877.729
    Smit AFA, Hubley R, Green P. (n.d.) RepeatMasker Open-3.0.
    Autor: H Li
    Título: The Sequence Alignment/Map format and SAMtools
    Título do periódico: Bioinformatics
    Volume: 25
    Primeira página: 2078
    Ano: 2009
    DOI: 10.1093/bioinformatics/btp352
    Autor: ST Sherry
    Título: dbSNP: the NCBI database of genetic variation
    Título do periódico: Nucleic Acids Res
    Volume: 29
    Primeira página: 308
    Ano: 2001
    DOI: 10.1093/nar/29.1.308
    Autor: S Anderson
    Título: Sequence and organization of the human mitochondrial genome
    Título do periódico: Nature
    Volume: 290
    Primeira página: 457
    Ano: 1981
    DOI: 10.1038/290457a0
    Autor: RM Andrews
    Título: Reanalysis and revision of the Cambridge reference sequence for human mitochondrial DNA
    Título do periódico: Nat Genet
    Volume: 23
    Primeira página: 147
    Ano: 1999
    DOI: 10.1038/13779
    Autor: L Excoffier
    Título: Arlequin suite ver 3.5: a new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows
    Título do periódico: Mol Ecol Resour
    Volume: 10
    Primeira página: 564
    Ano: 2010
    DOI: 10.1111/j.1755-0998.2010.02847.x
    Autor: T Jombart
    Título: adegenet 1.3-1: new tools for the analysis of genome-wide SNP data
    Título do periódico: Bioinformatics
    Volume: 27
    Primeira página: 3070
    Ano: 2011
    DOI: 10.1093/bioinformatics/btr521
    R Core Team (2013) R: A Language and Environment for Statistical Computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. ISBN 3-900051-07-0.
    Autor: D Reich
    Título: Reconstructing Indian population history
    Título do periódico: Nature
    Volume: 461
    Primeira página: 489
    Ano: 2009
    DOI: 10.1038/nature08365
    Autor: JK Pickrell
    Título: Inference of population splits and mixtures from genome-wide allele frequency data
    Título do periódico: PLoS Genet
    Volume: 8
    Primeira página: e1002967
    Ano: 2012
    DOI: 10.1371/journal.pgen.1002967
    Autor: D Falush
    Título: Inference of population structure using multilocus genotype data: dominant markers and null alleles
    Título do periódico: Mol Ecol Notes
    Volume: 7
    Primeira página: 574
    Ano: 2007
    DOI: 10.1111/j.1471-8286.2007.01758.x