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Testes de associação em região de QTL ligados do cromossomo 1 da galinha doméstica (2014)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: ATTÍLIO, DÊNIA BORGES - ESALQ
  • USP Schools: ESALQ
  • Subjects: GALINHAS; MARCADOR MOLECULAR; CARCAÇA; CRESCIMENTO ANIMAL; GENÔMICA
  • Language: Português
  • Abstract: Atualmente, o Brasil é considerado o maior exportador mundial e terceiro maior produtor mundial de carne de frango. Este destaque é resultado, principalmente, do melhoramento animal baseado na estimação do valor genético a partir da mensuração de fenótipos e informações de pedigree. Entretanto, é comum que a seleção não seja feita para cada característica isoladamente devido à correlação genética entre elas. Esta correlação tem como causas a pleiotropia ou a ligação genética. Com este trabalho objetivou-se detectar associações entre características fenotípicas de interesse para a avicultura e SNPs em uma região do cromossomo 1 (168 - 208 cM e 57 - 71 Mbp), onde possíveis QTL ligados foram previamente mapeados. Utilizou-se o Beadchip de SNPs de 60k para genotipar 14 animais da geração Parental (machos TT e fêmeas CC) e 28 F1 da população TCTC desenvolvida pela Embrapa Suínos e Aves. A linhagem TT apresentou maior variabilidade genotípica que CC, porém, os F1 foram superiores às linhagens Parentais com base no número de heterozigotos e MAF. O polimorfismo com maior ocorrência em ambas as gerações foram as transições com 84,3%. Foram selecionados 144 SNPs mais informativos com base na heterozigosidade dos cinco casais F1 que geraram os 453 F2. Houve redução de heterozigotos e MAF em F2, em função da média de F1, decorrente de certo grau de parentesco e endogamia entre os animais que compuseram esta geração. Os blocos de haplótipos construídos demonstraram que os machos TTapresentaram 25 blocos, fêmeas CC (17), F1 (32) e F2 (23) com tamanho médio de 278, 467, 242 e 160 kpb, respectivamente. Foi evidenciado que 236 (42,7%) correlações fenotípicas foram significativas, das quais o maior número constatado foi entre PB_MS e outras 17 características e, o maior valor estimado foi entre PB_MS e EE_MS (-0,90). Do total esperado de 3.456 testes de associação, 609 (17,6%) foram considerados significativos (p < 0,05), sendo 424 (69,6%) com efeito aditivo e 185 com efeito de dominância (30,4%). PV41 apresentou maior número de associações (123), enquanto DOR não foi associado a nenhum SNP. Proporcionalmente, o maior número de SNPs foi associado próximo ao QTL pleiotrópico 2 para 17 características. Já os maiores níveis de significância (p < 9,59 x 10-8) para o efeito aditivo foram evidenciados para SNPs localizados próximos ao QTL pleiotrópico 1 e associados somente com PV41, a saber: Gga_rs13869715 (A < C), Gga_rs13870613 (T < C), Gga_rs14827719 (A < G), GGaluGA019336 (T < C) e GGaluGA019533 (A < C). Foram detectadas associações ainda não descritas na literatura para GP3541, CA3541, INT, PES, CAB, FIG, COR, MOE, PUL, HEM, COL, TRI, TC, PB_MS, EE_MS, CZ_MS. Finalmente, foram indicados possíveis genes candidatos posicionais e funcionais, tais como, IGF1, MYBPC1, MTPN, SOX-5, FGFR1OP2 e TTLL12 que poderão ser empregados na análise de expressão gênica
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 14.04.2014
  • Acesso online ao documento

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    BibliotecaCód. de barrasNúm. de chamada
    ESABC12700015134ATTÍLIO, D. B.
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    • ABNT

      ATTILIO, Dênia Borges; ROSÁRIO, Millor Fernandes do. Testes de associação em região de QTL ligados do cromossomo 1 da galinha doméstica. 2014.Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2014. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-30042014-104202/ >.
    • APA

      Attilio, D. B., & Rosário, M. F. do. (2014). Testes de associação em região de QTL ligados do cromossomo 1 da galinha doméstica. Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-30042014-104202/
    • NLM

      Attilio DB, Rosário MF do. Testes de associação em região de QTL ligados do cromossomo 1 da galinha doméstica [Internet]. 2014 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-30042014-104202/
    • Vancouver

      Attilio DB, Rosário MF do. Testes de associação em região de QTL ligados do cromossomo 1 da galinha doméstica [Internet]. 2014 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-30042014-104202/

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