Ver registro no DEDALUS
Exportar registro bibliográfico

Metrics


Metrics:

Development of a Real-time PCR test for porcine group A rotavirus diagnosis (2015)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: GREGORI, FABIO - FMVZ
  • USP Schools: FMVZ
  • DOI: 10.1590/S0100-736X2015000100009
  • Subjects: REAÇÃO EM CADEIA POR POLIMERASE; ROTAVÍRUS ANIMAL; SUÍNOS
  • Language: Inglês
  • Abstract: Rotavírus do grupo A (RVA) é uma das causas mais frequentes de diarreias em humanos e várias espécies animais. Um teste de PCR em Tempo Real com SYBR-Green foi desenvolvido visando o diagnóstico de RVA a partir de fezes suínas, através da amplificação de um fragmento de 137 pares de bases do gene da proteína não estrutural 5 (NSP5) viral e de mRNA de NADH-desidrogenase-5 bovina como controle interno exógeno. Foram testadas 65 amostras (25 delas positivas por PCR convencional e sequenciamento nucleotídico). A concordância entre os testes foi de 0,843, considerada "muito boa", apresentando 100% de sensibilidade relativa (25+ PCR Tempo Real/25+ PCR convencional) e 87,5% de sensibilidade relativa (35- PCR Tempo Real/40- PCR convencional). Os resultados também demonstraram elevada reprodutibilidade inter e intra-ensaio (coeficiente de variação ≤ 1,42%); portanto, este método demonstrou ser uma rápida e sensível alternativa para o diagnóstico de RVA em suínos
  • Imprenta:
  • Source:
  • Acesso online ao documento

    Online accessDOI or search this record in
    Informações sobre o DOI: 10.1590/S0100-736X2015000100009 (Fonte: oaDOI API)
    • Este periódico é de acesso aberto
    • Este artigo é de acesso aberto
    • URL de acesso aberto
    • Cor do Acesso Aberto: hybrid
    • Licença: cc-by-nc
    Versões disponíveis em Acesso Aberto do: 10.1590/S0100-736X2015000100009 (Fonte: Unpaywall API)

    Título do periódico: Pesquisa Veterinária Brasileira

    ISSN: 0100-736X

    • Melhor URL em Acesso Aberto:


    • Outras alternativas de URLs em Acesso Aberto:


        • Página do artigo
        • Evidência: oa journal (via doaj)
        • Licença: cc-by-nc
        • Versão: publishedVersion
        • Tipo de hospedagem: publisher


    Informações sobre o Citescore
  • Título: Pesquisa Veterinaria Brasileira

    ISSN: 0100-736X

    Citescore - 2017: 0.48

    SJR - 2017: 0.295

    SNIP - 2017: 0.59


  • Exemplares físicos disponíveis nas Bibliotecas da USP
    BibliotecaCód. de barrasNúm. de chamada
    FMVZ2693205-10GRF - 19
    How to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      MARCONI, Elizabeth C. M; BERNARDES, Nara T. C. G; BESERRA, Laila A. R; SILVA, Fernanda D. F; GREGORI, Fábio. Development of a Real-time PCR test for porcine group A rotavirus diagnosis. Pesquisa Veterinária Brasileira, Seropédica, v. 35, n. 1, p. 39-43, 2015. Disponível em: < http://dx.doi.org/10.1590/S0100-736X2015000100009 > DOI: 10.1590/S0100-736X2015000100009.
    • APA

      Marconi, E. C. M., Bernardes, N. T. C. G., Beserra, L. A. R., Silva, F. D. F., & Gregori, F. (2015). Development of a Real-time PCR test for porcine group A rotavirus diagnosis. Pesquisa Veterinária Brasileira, 35( 1), 39-43. doi:10.1590/S0100-736X2015000100009
    • NLM

      Marconi ECM, Bernardes NTCG, Beserra LAR, Silva FDF, Gregori F. Development of a Real-time PCR test for porcine group A rotavirus diagnosis [Internet]. Pesquisa Veterinária Brasileira. 2015 ; 35( 1): 39-43.Available from: http://dx.doi.org/10.1590/S0100-736X2015000100009
    • Vancouver

      Marconi ECM, Bernardes NTCG, Beserra LAR, Silva FDF, Gregori F. Development of a Real-time PCR test for porcine group A rotavirus diagnosis [Internet]. Pesquisa Veterinária Brasileira. 2015 ; 35( 1): 39-43.Available from: http://dx.doi.org/10.1590/S0100-736X2015000100009

    Referências citadas na obra
    Autor: Akashi H.
    Título: Properties of a coronavirus isolated from a cow with epizootic diarrhea.
    Título do periódico: Vet. Microbiol.
    Volume: 5
    Primeira página: 265
    Ano: 1980
    DOI: 10.1016/0378-1135(80)90025-5
    Autor: Amimo J.O.
    Título: Detection and genetic diversity of porcine group A rotaviruses in historic (2004) and recent (2011 and 2012) swine fecal samples in Ohio: predominance of the G9P[13] genotype in nursing piglets.
    Título do periódico: J. Clin. Microbiol.
    Volume: 51
    Primeira página: 1142
    Ano: 2013
    DOI: 10.1128/JCM.03193-12
    Autor: Asano K.M.
    Título: Multiplex semi-nested RT-PCR with exogenous internal control for simultaneous detection of bovine coronavirus and group A rotavirus.
    Título do periódico: J. Virol. Methods
    Volume: 169
    Primeira página: 375
    Ano: 2010
    DOI: 10.1016/j.jviromet.2010.08.008
    Autor: Barbosa B.R.
    Título: Molecular characterization of the porcine group A rotavirus NSP2 and NSP5/6 genes from São Paulo State, Brazil, in 2011/12.
    Título do periódico: Scient. World J.
    Ano: 2013
    DOI: 10.1155/2013/241686
    Autor: Caldwell J.M.
    Título: Mitochondrial multiplex real-time PCR as a source tracking method in fecal-contaminated effluents.
    Título do periódico: Environ. Sci. Technol.
    Volume: 41
    Primeira página: 3277
    Ano: 2007
    DOI: 10.1021/es062912s
    Autor: Contin R.
    Título: Rotavirus NSP5 orchestrates recruitment of viroplasmic proteins.
    Título do periódico: J. Gen. Virol.
    Volume: 91
    Primeira página: 1782
    Ano: 2010
    DOI: 10.1099/vir.0.019133-0
    Autor: Criglar J.M.
    Título: A novel form of rotavirus NSP2 and phosphorylation-dependent NSP2-NSP5 interactions are associated with viroplasm assembly.
    Título do periódico: J. Virol.
    Volume: 88
    Primeira página: 786
    Ano: 2014
    DOI: 10.1128/JVI.03022-13
    Autor: Dhama K.
    Título: Rotavirus diarrhea in bovines and other domestic animals.
    Título do periódico: Vet. Res. Commun.
    Volume: 33
    Primeira página: 1
    Ano: 2009
    DOI: 10.1007/s11259-008-9070-x
    Autor: Dorak M.T.
    Ano: 2006
    Autor: Estes M.K.
    Primeira página: 1917
    Ano: 2007
    Autor: Ghosh S.
    Título: Whole-genomic analysis of rotavirus strains: current status and future prospects.
    Título do periódico: Future Microbiol.
    Volume: 6
    Primeira página: 1049
    Ano: 2011
    DOI: 10.2217/fmb.11.90
    Autor: Gregori F.
    Título: Desenvolvimento de um método de ELISA para a detecção de rotavírus a partir de material fecal.
    Título do periódico: Arq. Inst. Biol.
    Volume: 67
    Primeira página: 191
    Ano: 2000
    Autor: Gregori F.
    Título: Diversidade intra-genotípica de amostras de rotavírus suínas circulantes no Estado de São Paulo, Brasil
    Título do periódico: Ars Vet.
    Volume: 28
    Primeira página: 28
    Ano: 2012
    Autor: Herring A.J.
    Título: Rapid diagnosis of rotavirus infection by direct detection of viral nucleic acid in silver-stained polyacrylamide gels.
    Título do periódico: J. Clin. Microbiol.
    Volume: 16
    Primeira página: 473
    Ano: 1982
    Autor: Jerez J.A.
    Título: Diarréias virais dos bezerros: rotavírus e coronavírus.
    Título do periódico: Biológico
    Volume: 59
    Primeira página: 33
    Ano: 1997
    Autor: King A.M.Q.
    Primeira página: 603
    Ano: 2012
    Autor: Larkin M.A.
    Título: Clustal W and Clustal X version 2.0.
    Título do periódico: Bioinformatics
    Volume: 23
    Primeira página: 2947
    Ano: 2007
    DOI: 10.1093/bioinformatics/btm404
    Autor: Matthijnssens J.
    Título: Uniformity of rotavirus strain nomenclature proposed by the Rotavirus Classification Working Group (RCWG).
    Título do periódico: Arch. Virol.
    Volume: 156
    Primeira página: 1397
    Ano: 2011
    DOI: 10.1007/s00705-011-1006-z
    Autor: Mijatovic-Rustempasic S.
    Título: Sensitive and specific quantitative detection of rotavirus A by one-step real-time reverse transcription-PCR assay without antecedent double-stranded-RNA denaturation.
    Título do periódico: J. Clin. Microbiol.
    Volume: 51
    Primeira página: 3047
    Ano: 2013
    DOI: 10.1128/JCM.01192-13
    Autor: Pang X.L.
    Título: Increased detection of rotavirus using a real time reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) assay in stool specimens from children with diarrhea.
    Título do periódico: J. Med. Virol.
    Volume: 72
    Primeira página: 496
    Ano: 2004
    DOI: 10.1002/jmv.20009
    Autor: Papp H.
    Título: Review of group A rotavirus strains reported in swine and cattle.
    Título do periódico: Vet. Microbiol.
    Volume: 165
    Primeira página: 190
    Ano: 2013
    DOI: 10.1016/j.vetmic.2013.03.020
    Autor: Pestana E.A.
    Primeira página: 27
    Ano: 2010
    Autor: Rodriguez C.A.R.
    Título: Improved animal rotavirus isolation in MA-104 cells using different trypsine concentrations.
    Título do periódico: Arqs Inst. Biológico
    Volume: 71
    Primeira página: 437
    Ano: 2004
    Autor: Salem A.N.B.
    Título: Multiplex nested RT-PCR for the detection of porcine enteric viruses.
    Título do periódico: J. Virol. Methods
    Volume: 165
    Primeira página: 283
    Ano: 2010
    DOI: 10.1016/j.jviromet.2010.02.010
    Autor: SantaLucia J.
    Título: Physical principles and visual-OMP software for optimal PCR design
    Título do periódico: PCR Primer Design: methods in molecular biology.
    Primeira página: 3
    Ano: 2007
    DOI: 10.1007/978-1-59745-528-2_1
    Autor: Sariya L.
    Título: Development of a SYBR Green I-based real-time PCR for detection of elephant endotheliotropic herpesvirus 1 infection in Asian elephants (Elephas maximus)
    Título do periódico: J. Virol. Methods
    Volume: 185
    Primeira página: 160
    Ano: 2012
    DOI: 10.1016/j.jviromet.2012.06.005
    Autor: Thrusfield M.
    Primeira página: 305
    Ano: 2007
    Autor: Ye X.Y.
    Título: Real-time PCR detection of enteric viruses in source water and treated drinking water in Wuhan, China
    Título do periódico: Curr. Microbiol
    Volume: 65
    Primeira página: 244
    Ano: 2012
    DOI: 10.1007/s00284-012-0152-1
    Autor: Zhu J.
    Título: Development of porcine rotavirus vp6 protein based ELISA for differentiation of this virus and other viruses.
    Título do periódico: Virol. J.
    Volume: 10
    Ano: 2013