Ver registro no DEDALUS
Exportar registro bibliográfico

Descrição e caracterização de uma nova ?-N-acetil-hexosaminidase (GH3) por metagenômica de solo de manguezal (2015)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: SOARES JúNIOR, FáBIO LINO - CENA
  • USP Schools: CENA
  • Subjects: BIODIVERSIDADE; ECOSSISTEMAS DE MANGUE; ENZIMAS CELULOLÍTICAS; MATÉRIA ORGÂNICA DO SOLO
  • Keywords: Bioprospecção; Bioprospecting; Enzimas; Enzymes; Fosmid; Fosmídeo; Screnning; SDS-PAGE
  • Language: Português
  • Abstract: Bactéria e fungos são as principais fontes de enzimas envolvidas na transformação de compostos chave para o fluxo de carbono em solos de manguezal, caracterizado por alta prevalência de anaerobiose, salinidade e elevado teor de matéria orgânica. A decomposição de plantas ou resíduos de animais nestas condições é muito lenta, devido à pressão seletiva sobre a evolução de enzimas envolvidas nos processos de mineralização de nutrientes. A metagenômica, permiti o acesso a grande maioria da diversidade microbiana no ambiente, por meio da geração de bibliotecas de clones, o que resulta em um cenário promissor para bioprospecção de novas atividades enzimáticas. Neste estudo, foi relatada a descrição e caracterização de uma nova ?-N-acetil-hexosaminidase (EC 3.2.1.52) da família GH3, envolvida na degradação da matéria orgânica em solo de manguezal contaminado por derramamento de óleo localizado no município de Bertioga-SP, por meio de uma triagem de 12.960 clones metagenômicos. O clone positivo para a atividade celulolítica foi sequenciado e um total de 1.175.586 reads foram gerados com tamanho médio de 198 pb. As sequencias foram trimadas com base na qualidade de índice PHRED >= 30.0, e remoção de sequencias do hospedeiro (E. coli) e do vetor (fosmídeo), originando um contig final com 39.586 Kb. Entre as ORF\'s anotadas a partir do contig gerado, uma sequencia de 1.065 nucleotídeos foi identificada como codificante para a enzima ?-N-acetil-hexosaminidase, evidenciando baixasimilaridade (32 %) com as demais encontradas no bancos de dados comparativos. A enzima foi expressa e purificada, onde uma banda isolada foi visualizada por SDS-PAGE com massa molecular prevista de 43 kDa. Por fim, as atividades ótimas da enzima (30 °C; pH 5.0; 0.5 M de NaCl; diminuição de atividade após 3hs de incubação) foram caracterizadas por meio do indicador p-nitrophenol (pNP) ligados aos substratos GlNac, GalNac e Glc. A detecção da enzima por meio da metagenômica, evidenciou que os manguezais são reservatórios de novas enzimas com características diferenciadas e altos potenciais de aplicabilidades biotecnológicas
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 25.08.2015
  • Acesso online ao documento

    Online access or search this record in

    Exemplares físicos disponíveis nas Bibliotecas da USP
    BibliotecaCód. de barrasNúm. de chamada
    CENA12800012251(043) S676d e.1 12519
    How to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      SOARES JÚNIOR, Fábio Lino; AZEVEDO, João Lucio de; LIMA, André Oliveira de Souza. Descrição e caracterização de uma nova ?-N-acetil-hexosaminidase (GH3) por metagenômica de solo de manguezal. 2015.Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2015. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-27012016-141443/ >.
    • APA

      Soares Júnior, F. L., Azevedo, J. L. de, & Lima, A. O. de S. (2015). Descrição e caracterização de uma nova ?-N-acetil-hexosaminidase (GH3) por metagenômica de solo de manguezal. Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-27012016-141443/
    • NLM

      Soares Júnior FL, Azevedo JL de, Lima AO de S. Descrição e caracterização de uma nova ?-N-acetil-hexosaminidase (GH3) por metagenômica de solo de manguezal [Internet]. 2015 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-27012016-141443/
    • Vancouver

      Soares Júnior FL, Azevedo JL de, Lima AO de S. Descrição e caracterização de uma nova ?-N-acetil-hexosaminidase (GH3) por metagenômica de solo de manguezal [Internet]. 2015 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-27012016-141443/

    Últimas obras dos mesmos autores vinculados com a USP cadastradas na BDPI: