Molecular analysis of NSP4 coding gene of porcine rotavirus in Brazil (2015)
- Authors:
- USP affiliated authors: BRANDÃO, PAULO EDUARDO - FMVZ ; RUIZ, VERA LETTICIE DE AZEVEDO - FZEA ; GREGORI, FABIO - FMVZ
- Unidades: FMVZ; FZEA
- Subjects: GENÓTIPOS; PROTEÍNAS; REOVIRIDAE; ROTAVÍRUS ANIMAL; SUÍNOS
- Language: Inglês
- Abstract: A proteína não estrutural 4 (NSP4) desempenha diferentes funções na replicação e na morfogênese dos rotavírus, apresentando, ainda, uma atividade de enterotoxina, causando diarreia do tipo secretória. Um total de 11 sequências parciais de nucleotídeos do gene codificador da NSP4 de rotavírus suínos de criações brasileiras foram definidas como pertencentes ao grupo A. Comparando-se as sequências virais da área do peptídeo toxigênico, que compreende a porção entre os aminoácidos de 114 a 135, constatou-se uma única mutação pontual no aminoácido 135, sendo que duas amostras apresentaram alanina, e as demais, valina. A análise filogenética do gene demonstrou que todas as amostras pertencem ao genotipo E1, e que a identidade nucleotídica das amostras brasileiras variou de 92,4% a 100%, enquanto que a identidade de aminoácidos, de 95,8% a 100%. Apenas um resíduo (aa 138) sofreu seleção positiva enquanto que pelo menos outros 119 apresentam seleção negativa. Assim, esses dados mostram a ocorrência de um genotipo comum da NSP4 já descrito anteriormente em suínos, com uma baixa diversidade entre as amostras encontradas
- Imprenta:
- Publisher place: Jaboticabal
- Date published: 2015
- Source:
- Título do periódico: Ars Veterinaria
- ISSN: 0102-6380
- Volume/Número/Paginação/Ano: v. 31, n. 1, p. 42-49, 2015
-
ABNT
CUNHA, Elenice Maria Sequetin et al. Molecular analysis of NSP4 coding gene of porcine rotavirus in Brazil. Ars Veterinaria, v. 31, n. 1, p. 42-49, 2015Tradução . . Disponível em: http://arsveterinaria.org.br/index.php/ars/article/view/827/997. Acesso em: 27 abr. 2024. -
APA
Cunha, E. M. S., Brandão, P. E., Nishida, M. K., Ruiz, V. L. de A., & Gregori, F. (2015). Molecular analysis of NSP4 coding gene of porcine rotavirus in Brazil. Ars Veterinaria, 31( 1), 42-49. Recuperado de http://arsveterinaria.org.br/index.php/ars/article/view/827/997 -
NLM
Cunha EMS, Brandão PE, Nishida MK, Ruiz VL de A, Gregori F. Molecular analysis of NSP4 coding gene of porcine rotavirus in Brazil [Internet]. Ars Veterinaria. 2015 ; 31( 1): 42-49.[citado 2024 abr. 27 ] Available from: http://arsveterinaria.org.br/index.php/ars/article/view/827/997 -
Vancouver
Cunha EMS, Brandão PE, Nishida MK, Ruiz VL de A, Gregori F. Molecular analysis of NSP4 coding gene of porcine rotavirus in Brazil [Internet]. Ars Veterinaria. 2015 ; 31( 1): 42-49.[citado 2024 abr. 27 ] Available from: http://arsveterinaria.org.br/index.php/ars/article/view/827/997 - Phylogenetic analyses of the VP4 and VP7 genes of porcine group a rotaviruses in São Paulo, state, Brazil: first identification of G5P[23] in piglets
- Detection of group a rotavirus and absence of group 1 coronavirus (transmissible gastroenteritis virus and porcine epidemic diarrhea virus) in piglets' feces by RT-Multiplex-Nested-PCR
- A case-control study of infectious agents and parasites involved in diarrhea in piglets
- Ocorrência de agentes bacterianos em fezes de leitões com até 30 dias de idade no estado de São Paulo
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- Detection and molecular characterization of VP7 and VP4 genes of group a rotavirus by nested RT-PCR in piglet s feces from São Paulo State, Brazil
- Molecular characterization of gene encoding the non-structural protein 2 (NSP2) of swine rotavirus from São Paulo State, Brazil
- Rotavírus
- Co-circulation of astrovirus, rotavirus and coronavirus in Brazilian avian farms
- Occurrence and characterization of rotavirus A in broilers, layers, and broiler breeders from brazilian poultry farms
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