Mapeamento associativo para múltiplos ambientes e múltiplos locos, visando tolerância à seca em milho (2016)
- Authors:
- Autor USP: ANONI, CARINA DE OLIVEIRA - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LGN
- Subjects: GENOMAS; GERMOPLASMA VEGETAL; INTERAÇÃO GENÓTIPO-AMBIENTE; MAPEAMENTO GENÉTICO; MILHO; SECA; VARIAÇÃO GENÉTICA EM PLANTAS
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: A seca é um dos estresses abióticos mais importantes na cultura do milho, o qual ocasiona reduções significativas na produção de grãos. A arquitetura genética da tolerância à seca é complexa, fazendo-se necessária a melhor compreensão desse caráter. Estudos envolvendo mapeamento associativo são úteis por explorarem a variação genética de caracteres quantitativos e, adicionalmente, levam em conta informações acerca de genótipos, ambientes e interações genótipo por ambiente (G × E). Ao considerar efeitos de G × E em modelos de mapeamento associativo há possibilidade de identificar regiões no genoma associadas à condições e ambientes específicos. Este trabalho teve como objetivo detectar associações relacionadas à tolerância à seca em milho por meio de um modelo de mapeamento associativo para múltiplos ambientes e múltiplos locos, o qual permitiu distinguir associações com efeitos ambiente-específico daquelas com efeitos principais e de interação associação por ambiente (QEI). O painel associativo foi composto por 190 linhagens, classificadas de acordo com os grupos heteróticos quanto ao tipo de grão. Marcadores SNPs (∼500k) foram utilizados para a genotipagem do painel associativo. Duas linhagens (L228-3 e L3) foram usadas como testadores comuns e os híbridos obtidos foram avaliados em duas localidades (Janaúba-MG e Teresina-PI), dois anos agrícolas (2010 e 2011), sob duas condições de tratamento (irrigado e não irrigado). Ao total, consideraram-se seis caracteres: peso degrãos, intervalo de florescimento, florescimento feminino e masculino, altura de planta e de espiga. Consideraram-se dois grupos de mapeamento, agrupados de acordo com os testadores utilizados. SNPs foram úteis para testar associações ao longo do genoma do milho e investigar o relacionamento genético entre indivíduos. O modelo de mapeamento associativo, com inclusão de informações sobre interação G × E, detectou o total de 179 associações, e o maior número de associações foram relacionadas aos caracteres de florescimento. A maioria das associações (168) apresentaram QEI significativo, sendo que o tamanho e a magnitude desses efeitos distinguiram-se de acordo com o ambiente em avaliação. Apenas o caráter florescimento feminino não apresentou associações com efeitos estáveis ao longo dos ambientes em estudo. A detecção de algumas associações em posições próximas do genoma evidenciam possíveis efeitos de pleiotropia. Algumas associações foram co-localizadas em regiões do genoma do milho relacionadas à tolerância à seca, sendo que algumas dessas associações estavam envolvidas a fatores pertencentes à vias metabólicas de interesse. O presente estudo forneceu informações úteis para a compreensão da base genética da tolerância à seca em milho sob os ambientes específicos em avaliação
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2016
- Data da defesa: 08.04.2016
-
ABNT
ANONI, Carina de Oliveira. Mapeamento associativo para múltiplos ambientes e múltiplos locos, visando tolerância à seca em milho. 2016. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2016. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-11052016-103352/. Acesso em: 18 abr. 2024. -
APA
Anoni, C. de O. (2016). Mapeamento associativo para múltiplos ambientes e múltiplos locos, visando tolerância à seca em milho (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-11052016-103352/ -
NLM
Anoni C de O. Mapeamento associativo para múltiplos ambientes e múltiplos locos, visando tolerância à seca em milho [Internet]. 2016 ;[citado 2024 abr. 18 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-11052016-103352/ -
Vancouver
Anoni C de O. Mapeamento associativo para múltiplos ambientes e múltiplos locos, visando tolerância à seca em milho [Internet]. 2016 ;[citado 2024 abr. 18 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-11052016-103352/
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