Estudo teórico da espectroscopia da clorofila d (2017)
- Authors:
- Autor USP: NUÑEZ, ARGEL NASIR SOSA - IF
- Unidade: IF
- Sigla do Departamento: FGE
- Subjects: ESPECTROSCOPIA; CLOROFILA; ABSORÇÃO; SOLVENTE
- Language: Português
- Abstract: Neste trabalho estudamos o espectro de absorção da clorofila d, incluindo os efeitos do solvente metanol, utilizando a Teoria do Funcional da Densidade Dependente do Tempo em combinação com o método s-QM/MM. Diferentes abordagens para a descrição do meio solvente, que vão desde o modelo contínuo polarizável até a inclusão de moléculas explícitas do solvente, são utilizadas. Observamos que a inclusão do solvente desloca o espectro, em relação ao calculado em vácuo, para o vermelho. A inclusão de 20 moléculas explícitas de metanol e 880 representadas como as cargas pontuais do seus átomos para a descrição do meio solvente foi a que melhor concordou com os valores experimentais. Mediante cálculos de mecânica quântica obtivemos para o complexo composto por a molécula de clorofila d e apenas uma de metanol explícita um deslocamento do átomo de magnésio da clorofila d em relação ao anel de 0,31 Å. Mediante a analise da função de distribuição radial de pares obtida da simulação clássica comprovamos que esse átomo de magnésio é penta-coordenado. Além disso, é usada uma estrutura simplificada da clorofila d baseado na localização dos orbitais moleculares participantes das transições eletrônicas com o objetivo de diminuir o custo computacional dos cálculos de mecânica quântica. Os espectros calculados para a clorofila d não apresentaram diferenças significativas com os calculados para a simplificação proposta. Como complementação o espectro Raman da clorofila d isolada é calculado mediante DFT e alguns dos modos normais são caracterizados.
- Imprenta:
- Data da defesa: 09.10.2017
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ABNT
SOSA NUÑEZ, Argel Nasir. Estudo teórico da espectroscopia da clorofila d. 2017. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2017. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-19112017-173908/. Acesso em: 17 abr. 2024. -
APA
Sosa Nuñez, A. N. (2017). Estudo teórico da espectroscopia da clorofila d (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-19112017-173908/ -
NLM
Sosa Nuñez AN. Estudo teórico da espectroscopia da clorofila d [Internet]. 2017 ;[citado 2024 abr. 17 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-19112017-173908/ -
Vancouver
Sosa Nuñez AN. Estudo teórico da espectroscopia da clorofila d [Internet]. 2017 ;[citado 2024 abr. 17 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-19112017-173908/
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