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Genomic study and Medical Subject Headings enrichment analysis of early pregnancy rate and antral follicle numbers in Nelore heifers (2017)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: FERRAZ, JOSÉ BENTO STERMAN - FZEA
  • USP Schools: FZEA
  • DOI: 10.2527/jas2017.1752
  • Subjects: MELHORAMENTO GENÉTICO ANIMAL; FOLÍCULO OVARIANO; REPRODUÇÃO APLICADA ANIMAL; GENÔMICA; NOVILHOS; GADO NELORE
  • Language: Inglês
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    Título do periódico: Journal of Animal Science

    ISSN: 1525-3163

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    Informações sobre o Citescore
  • Título: Journal of Animal Science

    ISSN: 0021-8812

    Citescore - 2017: 1.61

    SJR - 2017: 0.848

    SNIP - 2017: 0.982


  • Exemplares físicos disponíveis nas Bibliotecas da USP
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    FZEA2863673-10PCD^2017^Gen
    How to cite
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    • ABNT

      OLIVEIRA JÚNIOR, Gerson Antônio; PEREZ, B. C; COLE, J B; et al. Genomic study and Medical Subject Headings enrichment analysis of early pregnancy rate and antral follicle numbers in Nelore heifers. Journal of Animal Science, Cary, NC, v. 95, n. 11, p. 4796-4812, 2017. Disponível em: < https://doi.org/10.2527/jas2017.1752 > DOI: 10.2527/jas2017.1752.
    • APA

      Oliveira Júnior, G. A., Perez, B. C., Cole, J. B., Santana, M. H. de A., Silveira, J., Mazzoni, G., et al. (2017). Genomic study and Medical Subject Headings enrichment analysis of early pregnancy rate and antral follicle numbers in Nelore heifers. Journal of Animal Science, 95( 11), 4796-4812. doi:10.2527/jas2017.1752
    • NLM

      Oliveira Júnior GA, Perez BC, Cole JB, Santana MH de A, Silveira J, Mazzoni G, Ventura RV, Santana Júnior ML, Kadarmideen HN, Garrick DJ, Ferraz JBS. Genomic study and Medical Subject Headings enrichment analysis of early pregnancy rate and antral follicle numbers in Nelore heifers [Internet]. Journal of Animal Science. 2017 ; 95( 11): 4796-4812.Available from: https://doi.org/10.2527/jas2017.1752
    • Vancouver

      Oliveira Júnior GA, Perez BC, Cole JB, Santana MH de A, Silveira J, Mazzoni G, Ventura RV, Santana Júnior ML, Kadarmideen HN, Garrick DJ, Ferraz JBS. Genomic study and Medical Subject Headings enrichment analysis of early pregnancy rate and antral follicle numbers in Nelore heifers [Internet]. Journal of Animal Science. 2017 ; 95( 11): 4796-4812.Available from: https://doi.org/10.2527/jas2017.1752

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    Ano: 2015
    DOI: 10.1096/fj.14-269209
    Título: Bovine sperm binding to oviductal epithelium involves fucose recognition
    Título do periódico: Biol. Reprod.
    Volume: 56
    Primeira página: 1198
    Ano: 1997
    DOI: 10.1095/biolreprod56.5.1198
    Título: Single step, a general approach for genomic selection
    Título do periódico: Livest. Sci.
    Volume: 166
    Primeira página: 54
    Ano: 2014
    DOI: 10.1016/j.livsci.2014.04.029
    Título: Non-esterified fatty acids in follicular fluid of dairy cows and their effect on developmental capacity of bovine oocytes in vitro
    Título do periódico: Reproduction
    Volume: 130
    Primeira página: 485
    Ano: 2005
    DOI: 10.1530/rep.1.00735
    Título: Loss-of-function mutation in GATA4 causes anomalies of human testicular development
    Título do periódico: Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
    Volume: 108
    Primeira página: 1597
    Ano: 2011
    DOI: 10.1073/pnas.1010257108
    Título: New members of the insulin family: Regulators of metabolism, growth and now reproduction
    Título do periódico: Pediatr. Res.
    Volume: 57
    Primeira página: 70R
    Ano: 2005
    DOI: 10.1203/01.PDR.0000159573.55187.CA
    Título: TOPAZ1, a germ cell specific factor, is essential for male meiotic progression
    Título do periódico: Dev. Biol.
    Volume: 406
    Primeira página: 158
    Ano: 2015
    DOI: 10.1016/j.ydbio.2015.09.002
    Título: Single nucleotide polymorphisms in the growth hormone-insulin-like growth factor axis in straightbred and crossbred Angus, Brahman, and Romosinuano heifers: Population genetic analyses and association of genotypes with reproductive phenotypes
    Título do periódico: J. Anim. Sci.
    Volume: 89
    Primeira página: 926
    Ano: 2011
    DOI: 10.2527/jas.2010-3483
    Título: The role of luteinizing hormone in regulating gene expression during selection of a dominant follicle in cattle
    Título do periódico: Biol. Reprod.
    Volume: 84
    Primeira página: 369
    Ano: 2011
    DOI: 10.1095/biolreprod.110.085274
    Título: Entrez Gene : gene-centered information at NCBI
    Título do periódico: Nucleic Acids Res.
    Volume: 39
    Primeira página: 52
    Ano: 2011
    DOI: 10.1093/nar/gkq1237
    Título: An important role of Pumilio 1 in regulating the development of the mammalian female germline
    Título do periódico: Biol. Reprod.
    Volume: 94
    Primeira página: 134
    Ano: 2016
    Título: Impact of linoleic acid on bovine oocyte maturation and embryo development
    Título do periódico: Reproduction
    Volume: 139
    Primeira página: 979
    Ano: 2010
    DOI: 10.1530/REP-09-0503
    Título: RGS14 is a mitotic spindle protein essential from the first division of the mammalian zygote
    Título do periódico: Dev. Cell
    Volume: 7
    Primeira página: 763
    Ano: 2004
    DOI: 10.1016/j.devcel.2004.10.004
    Título: Fatty acid composition of lipids in immature cattle, pig and sheep oocytes with intact zona pellucida
    Título do periódico: J. Reprod. Fertil.
    Volume: 118
    Primeira página: 163
    Ano: 2000
    Título: Toward the identification of a subset of unexplained infertility: A sperm proteomic approach
    Título do periódico: Fertil. Steril.
    Volume: 102
    Primeira página: 692
    Ano: 2014
    DOI: 10.1016/j.fertnstert.2014.05.021
    Título: Defective postnatal development of the male reproductive tract in LGR4 knockout mice
    Título do periódico: Dev. Biol.
    Volume: 290
    Primeira página: 421
    Ano: 2006
    DOI: 10.1016/j.ydbio.2005.11.043
    Título: Prediction of total genetic value using genome-wide dense marker maps
    Título do periódico: Genetics
    Volume: 157
    Primeira página: 1819
    Ano: 2001
    Misztal I. Tsuruta S. Lourenco D. A. L. Aguilar I. Legarra A. Vitezica Z. 2014. Manual for BLUPF90 family of programs. http://nce.ads.uga.edu/wiki/lib/exe/fetch.php?media=blupf90_all1.pdf. (Accessed 6 October 2016.)
    Título: Maternal disturbance in activated sphingolipid metabolism causes pregnancy loss in mice
    Título do periódico: J. Clin. Invest.
    Volume: 117
    Primeira página: 2993
    Ano: 2007
    DOI: 10.1172/JCI30674
    Título: An application of MeSH enrichment analysis in livestock
    Título do periódico: Anim. Genet.
    Volume: 46
    Primeira página: 381
    Ano: 2015
    DOI: 10.1111/age.12307
    Título: Saturated FFAs, palmitic acid and stearic acid, induce apoptosis in human granulosa cells
    Título do periódico: Endocrinology
    Volume: 142
    Primeira página: 3590
    Ano: 2001
    DOI: 10.1210/endo.142.8.8293
    Título: Biochemical identification of Xenopus Pumilio as a sequence-specific cyclin B1 mRNA-binding protein that physically interacts with a Nanos homolog, Xcat-2, and a cytoplasmic polyadenylation element-binding protein
    Título do periódico: J. Biol. Chem.
    Volume: 276
    Primeira página: 20945
    Ano: 2001
    DOI: 10.1074/jbc.M010528200
    Título: Involvement of Xenopus Pumilio in the translational regulation that is specific to cyclin B1 mRNA during oocyte maturation
    Título do periódico: Mech. Dev.
    Volume: 120
    Primeira página: 865
    Ano: 2003
    DOI: 10.1016/S0925-4773(03)00160-6
    Título: Biocompass: A novel functional inference tool that utilizes MeSH hierarchy to analyze groups of genes
    Título do periódico: In Silico Biol.
    Volume: 8
    Primeira página: 53
    Ano: 2007
    Título: The MeSH translation maintenance system: Structure, interface design, and implementation
    Título do periódico: Stud. Health Technol. Inform.
    Volume: 107
    Primeira página: 67
    Ano: 2004
    Título: Use of single nucleotide polymorphisms in candidate genes associated with daughter pregnancy rate for prediction of genetic merit for reproduction in Holstein cows
    Título do periódico: Anim. Genet.
    Volume: 47
    Primeira página: 288
    Ano: 2016
    DOI: 10.1111/age.12420
    Título: The Drosophila pumilio gene encodes two functional protein isoforms that play multiple roles in germline development, gonadogenesis, oogenesis and embryogenesis
    Título do periódico: Genetics
    Volume: 153
    Primeira página: 235
    Ano: 1999
    Título: Bayesian genome-wide association analysis of growth and yearling ultrasound measures of carcass traits in Brangus heifers
    Título do periódico: J. Anim. Sci.
    Volume: 90
    Primeira página: 3398
    Ano: 2012
    DOI: 10.2527/jas.2011-4507
    Título: Insulin-stimulated phosphorylation of protein phosphatase 1 regulatory subunit 12B revealed by HPLC-ESI-MS/MS
    Título do periódico: Proteome Sci.
    Volume: 10
    Primeira página: 52
    Ano: 2012
    DOI: 10.1186/1477-5956-10-52
    Título: Human speedy: A novel cell cycle regulator that enhances proliferation through activation of Cdk2
    Título do periódico: J. Cell Biol.
    Volume: 157
    Primeira página: 357
    Ano: 2002
    DOI: 10.1083/jcb.200109045
    Título: U3 snRNPs and nucleolar development during oocyte maturation, fertilization and early embryogenesis in the mouse: U3 snRNA and snRNPs are not regulated coordinate with other snRNAs and snRNPs
    Título do periódico: Dev. Biol.
    Volume: 138
    Primeira página: 247
    Ano: 1990
    DOI: 10.1016/0012-1606(90)90195-O
    Título: Expression of factors associated with apoptosis in the porcine corpus luteum throughout the luteal phase of the estrous cycle and early pregnancy: Their possible involvement in acquisition of luteolytic sensitivity
    Título do periódico: Theriogenology
    Volume: 83
    Primeira página: 535
    Ano: 2015
    DOI: 10.1016/j.theriogenology.2014.10.016
    Título: Interaction between thyroglobulin and ADAMTS16 in premature ovarian failure
    Título do periódico: Clin. Exp. Reprod. Med.
    Volume: 41
    Primeira página: 120
    Ano: 2014
    DOI: 10.5653/cerm.2014.41.3.120
    Título: Identification of some unknown transcripts from SSH cDNA library of buffalo follicular oocytes
    Título do periódico: Animal
    Volume: 7
    Primeira página: 446
    Ano: 2013
    DOI: 10.1017/S1751731112001620
    Autor: R Development Core Team
    Título: R: A language and environment for statistical computing
    Ano: 2013
    Título: Kisspeptin activates the hypothalamic-adenohypophyseal-gonadal axis in prepubertal ewe lambs
    Título do periódico: Reproduction
    Volume: 141
    Primeira página: 541
    Ano: 2011
    DOI: 10.1530/REP-10-0467
    Título: α-l-Fucosidase enhances capacitation-associated events in porcine spermatozoa
    Título do periódico: Vet. J.
    Volume: 203
    Primeira página: 109
    Ano: 2015
    DOI: 10.1016/j.tvjl.2014.11.006
    Título: ADAMTS proteases in fertility
    Título do periódico: Matrix Biol.
    Volume: 44–46
    Primeira página: 54
    Ano: 2015
    Título: Genome-wide association study reveals sex-specific selection signals against autosomal nucleotide variants
    Título do periódico: J. Hum. Genet.
    Volume: 61
    Primeira página: 423
    Ano: 2016
    DOI: 10.1038/jhg.2015.169
    Título: Genome-wide association mapping for female fertility traits in Danish and Swedish Holstein cattle
    Título do periódico: Anim. Genet.
    Volume: 41
    Primeira página: 579
    Ano: 2010
    DOI: 10.1111/j.1365-2052.2010.02064.x
    Título: Fatty acid synthesis and oxidation in cumulus cells support oocyte maturation in bovine
    Título do periódico: Mol. Endocrinol.
    Volume: 28
    Primeira página: 1502
    Ano: 2014
    DOI: 10.1210/me.2014-1049
    Título: Hippocampal gene expression is highly responsive to estradiol replacement in middle-aged female rats
    Título do periódico: Endocrinology
    Volume: 156
    Primeira página: 2632
    Ano: 2015
    DOI: 10.1210/en.2015-1109
    Título: Quantitative trait loci for fertility traits in Finnish Ayrshire cattle
    Título do periódico: Genet. Sel. Evol.
    Volume: 40
    Primeira página: 195
    Ano: 2008
    Título: Regulation of AP1 (Jun/Fos) factor expression and activation in ovarian granulosa cells. Relation of JunD and Fra2 to terminal differentiation
    Título do periódico: J. Biol. Chem.
    Volume: 275
    Primeira página: 33718
    Ano: 2000
    DOI: 10.1074/jbc.M003555200
    Título: ADAMTS-1 is involved in normal follicular development, ovulatory process and organization of the medullary vascular network in the ovary
    Título do periódico: J. Mol. Endocrinol.
    Volume: 35
    Primeira página: 343
    Ano: 2005
    DOI: 10.1677/jme.1.01735
    Título: boa: An R package for MCMC output convergence
    Título do periódico: J. Stat. Softw.
    Volume: 21
    Primeira página: 1
    Ano: 2007
    Título: Genetic variation and reproductive timing: African American women from the population architecture using genomics and epidemiology (PAGE) study
    Título do periódico: PLOS ONE
    Volume: 8
    Primeira página: e55258
    Ano: 2013
    DOI: 10.1371/journal.pone.0055258
    Título: Bull sperm binding to oviductal epithelium is mediated by a Ca2+-dependent lectin on sperm that recognizes Lewis-a trisaccharide
    Título do periódico: Biol. Reprod.
    Volume: 59
    Primeira página: 39
    Ano: 1998
    DOI: 10.1095/biolreprod59.1.39
    Título: Lyzl4, a novel mouse sperm-related protein, is involved in fertilization
    Título do periódico: Acta Biochim. Biophys. Sin. (Shanghai)
    Volume: 43
    Primeira página: 346
    Ano: 2011
    DOI: 10.1093/abbs/gmr017
    Título: Carbohydrates and glycoproteins involved in bovine fertilization in vitro
    Título do periódico: Mol. Reprod. Dev.
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    Primeira página: 492
    Ano: 2004
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    Título: Genome-wide association study for endocrine fertility traits using single nucleotide polymorphism arrays and sequence variants in dairy cattle
    Título do periódico: J. Dairy Sci.
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    Ano: 2016
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    Título do periódico: Hum. Reprod. Update
    Volume: 8
    Primeira página: 141
    Ano: 2002
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    Título: MeSH ORA framework: R/Bioconductor packages to support MeSH over-representation analysis
    Título do periódico: BMC Bioinf.
    Volume: 16
    Primeira página: 45
    Ano: 2015
    DOI: 10.1186/s12859-015-0453-z
    Autor: The UniProt Consortium
    Título: UniProt: A hub for protein information
    Título do periódico: Nucleic Acids Res.
    Volume: 43
    Primeira página: D204
    Ano: 2015
    DOI: 10.1093/nar/gku989
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    Título do periódico: Hum. Reprod.
    Volume: 15
    Fascículo: Suppl. 2
    Primeira página: 173
    Ano: 2000
    Título: Identification and expression of the family of classical protein-tyrosine phosphatases in zebrafish
    Título do periódico: PLOS ONE
    Volume: 5
    Primeira página: e12573
    Ano: 2010
    DOI: 10.1371/journal.pone.0012573
    Título: Efficient methods to compute genomic predictions
    Título do periódico: J. Dairy Sci.
    Volume: 91
    Primeira página: 4414
    Ano: 2008
    DOI: 10.3168/jds.2007-0980
    Título: Cathepsin mRNA level in bovine cumulus cells fails to be a good marker of oocyte quality
    Título do periódico: Anim. Sci. Pap. Rep.
    Volume: 34
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    Ano: 2016
    Título: Hypogonadism caused by a single amino acid substitution in the β subunit of luteinizing hormone
    Título do periódico: N. Engl. J. Med.
    Volume: 326
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    Ano: 1992
    DOI: 10.1056/NEJM199201163260306
    Título: Estradiol differentially modulates the exocytotic proteins SNAP-25 and munc-18 pituitary gonadotrophs
    Título do periódico: J. Mol. Endocrinol.
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    Ano: 2007
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    Título: Changes in alpha (1-2)-fucosyltransferase activity in the murine endometrial epithelium during the estrous cycle, early pregnancy, and after ovariectomy and hormone replacement
    Título do periódico: Biol. Reprod.
    Volume: 50
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    Ano: 1994
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    Título: Activity of Rho-family GTPases during cell division as visualized with FRET-based probes
    Título do periódico: J. Cell Biol.
    Volume: 162
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    Ano: 2003
    DOI: 10.1083/jcb.200212049
    Título: Seasonal changes in bovine fertility: Relation to developmental competence of oocytes, membrane properties and fatty acid composition of follicles
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    Volume: 121
    Primeira página: 447
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    DOI: 10.1186/gb-2009-10-4-r42
    Título: Molecular cloning and characterization of three novel lysozyme-like genes, predominantly expressed in the male reproductive system of humans, belonging to the C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
    Título do periódico: Biol. Reprod.
    Volume: 73
    Primeira página: 1064
    Ano: 2005
    DOI: 10.1095/biolreprod.105.041889