Avaliação da resistência de Mycobacterium tuberculosis a drogas através de testes fenotípicos, moleculares comerciais e do sequenciamento genômico total (2018)
- Authors:
- Autor USP: FELICIANO, CINARA SILVA - FMRP
- Unidade: FMRP
- Sigla do Departamento: RCM
- Subjects: CLÍNICA GERAL; TUBERCULOSE; MICROBIOLOGIA; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO
- Keywords: Antimicrobial susceptibility testing; Drug-resistant tuberculosis; Sequenciamento genômico; Testes de sensibilidade microbiana; Tuberculose resistente a múltiplos medicamentos; Whole genome equencing
- Language: Português
- Abstract: A tuberculose (TB) embora passável de tratamento efetivo, ainda é um grave problema de saúde pública em diversos países, inclusive no Brasil. Nas últimas décadas houve progressos consistentes no controle da doença, porém o avanço da resistência bacilar ainda é um desafio a ser superado, já que os mecanismos da resistência são bastante complexos e não totalmente conhecidos, o que dificulta o desenvolvimento de testes de sensibilidade com elevada acurácia. O objetivo deste trabalho foi caracterizar as mutações gênicas de cepas de Mycobacterium tuberculosis de pacientes do Brasil e de Moçambique com doença resistente a drogas através do sequenciamento genômico total, além de descrever padrões de mutações obtidas por testes moleculares comerciais e comparar estes dados com resultados de testes fenotípicos. Estudo descritivo e transversal que incluiu 30 isolados (17 do Brasil e 13 de Moçambique), submetidos aos testes moleculares comerciais Genotype MTBDRplus, Genotype MTBDRsl, Xpert MTB/RIF e teste fenotípico BACTEC MGIT 960 SIRE. Todos os isolados também foram avaliados pelo sequenciamento genômico realizado pelo lllumina MiSeq Sequencing System e submetidos a análise de mutações que conferem resistência às drogas contra TB utilizando o TB profiler online tool. A sensibilidade e especificidade do sequenciamento genômico para detecção de resistência a rifampicina foi de 87,5% e 92,3%, respectivamente. Além disso, o sequenciamento detectou a mutação (Val170Phe) no gene rpoB em dois isolados de M. tuberculosis de Moçambique. Esta mutação não é detectada pelos testes genotípicos comerciais. A sensibilidade do sequenciamento para a isoniazida foi de 95,6% e a especificidade de 100%. Para a estreptomicina, a sensibilidade foi de 85,7% e a especificidade de 93,3%. Para o etambutol, observamos sensibilidade de 100% e especificidade de 77,2%. As mutaçõesmais frequentes associadas à resistência à rifampicina foram a Ser450Leu e a His445Tyr no gene rpoB. Em relação à isoniazida, predominou a mutação Ser315Thr no gene katG. O sequenciamento genômico, dado seu alto poder discriminatório, tem grande potencial de fornecer informações mais acuradas sobre mecanismo gênicos da resistência bacilar, possibilitando futuramente o aprimoramento de testes diagnósticos mais precisos
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2018
- Data da defesa: 23.02.2018
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ABNT
FELICIANO, Cinara Silva. Avaliação da resistência de Mycobacterium tuberculosis a drogas através de testes fenotípicos, moleculares comerciais e do sequenciamento genômico total. 2018. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2018. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17138/tde-23072018-100514/. Acesso em: 24 abr. 2024. -
APA
Feliciano, C. S. (2018). Avaliação da resistência de Mycobacterium tuberculosis a drogas através de testes fenotípicos, moleculares comerciais e do sequenciamento genômico total (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17138/tde-23072018-100514/ -
NLM
Feliciano CS. Avaliação da resistência de Mycobacterium tuberculosis a drogas através de testes fenotípicos, moleculares comerciais e do sequenciamento genômico total [Internet]. 2018 ;[citado 2024 abr. 24 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17138/tde-23072018-100514/ -
Vancouver
Feliciano CS. Avaliação da resistência de Mycobacterium tuberculosis a drogas através de testes fenotípicos, moleculares comerciais e do sequenciamento genômico total [Internet]. 2018 ;[citado 2024 abr. 24 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17138/tde-23072018-100514/ - Perfil de sensibilidade e caracterização dos casos de tuberculose do Hospital das Clinicas da FMRP-USP
- Mycobacterium tuberculosis spoligotypes and drug-resistant characterization from Beira compared to genotypes circulating in Mozambique
- Xpert MTB/RIF performance to diagnose tuberculosis and rifampicin resistance in a reference centre in southern Brazil
- Accuracy of whole genome sequencing versus phenotypic (MGIT) and commercial molecular tests for detection of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis isolated from patients in Brazil and Mozambique
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