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Descoberta e caracterização de vírus emergentes e reergentes em áreas peri-florestais (2018)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: PAOLA, NICHOLAS DI - ICB
  • USP Schools: ICB
  • Subjects: PARVOVIRIDAE; VIROSES; FEBRE AMARELA; INFECÇÕES POR ARBOVIRUS; FILOGENIA; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO; EVOLUÇÃO
  • Keywords: Codon usage; Emerging virus; Evolução viral; Filogenia; Hidden Markov Models; Modelos Ocultos de Markov; Parvovirus B19; Parvovírus B19; Phylogeny; Uso do codão; Viral Evolution; Vírus da febre amarela; Vírus emergente; Yellow Fever virus
  • Language: Português
  • Abstract: A fragmentação e a invasão de florestas tropicais e a crescente concentração de assentamentos humanos aumentaram exponencialmente as chances de exposição a vírus emergentes e emergentes. Dado o grande potencial de espalhamento de patógenos em população humanas, a identificação e caracterização de agentes patogênicos circulantes podem melhorar a atenção primária e as capacidades de diagnóstico para um agente emergente futuro. As abordagens moleculares e metagenômicas que utilizam as tecnologias de sequenciação da próxima geração levaram a descoberta e caracterização de muitos vírus emergentes na última década. Além disso, as abordagens in silico também podem ajudar a identificar vírus emergentes usando apenas dados de sequenciamento publicamente disponíveis. Além disso, estimar a ascendência filogenética e até mesmo analisar as mudanças no uso de codons são ferramentas adicionais que podem melhorar a nossa compreensão de vírus emergentes ou reemergentes. Este projeto visou aplicar essas ferramentas em ambos os vírus que poderiam estar circulando no Brasil: Parvovírus B19 e vírus da Febre Amarela. Também exploramos as aplicações de modelos ocultos de Markov e índice de adaptação de codons usando dados publicamente disponíveis. Esperamos que este trabalho forneça uma prova de conceito para futuros projetos metagenômicos e demonstre a utilidade das várias técnicas moleculares e bioinformáticas no estudo de vírus emergentes
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 21.03.2018
  • Acesso online ao documento

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    • ABNT

      PAOLA, Nicholas Di; ZANOTTO, Paolo Marinho de Andrade. Descoberta e caracterização de vírus emergentes e reergentes em áreas peri-florestais. 2018.Universidade de São Paulo, São Paulo, 2018. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-26062018-095508/ >.
    • APA

      Paola, N. D., & Zanotto, P. M. de A. (2018). Descoberta e caracterização de vírus emergentes e reergentes em áreas peri-florestais. Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-26062018-095508/
    • NLM

      Paola ND, Zanotto PM de A. Descoberta e caracterização de vírus emergentes e reergentes em áreas peri-florestais [Internet]. 2018 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-26062018-095508/
    • Vancouver

      Paola ND, Zanotto PM de A. Descoberta e caracterização de vírus emergentes e reergentes em áreas peri-florestais [Internet]. 2018 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-26062018-095508/

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