Ver registro no DEDALUS
Exportar registro bibliográfico

Metrics


Metrics:

Functional characterization of a lytic polysaccharide monooxygenase from the thermophilic fungus Myceliophthora thermophila (2018)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: COSTA FILHO, ANTÔNIO JOSÉ DA - FFCLRP ; POLIKARPOV, IGOR - IFSC
  • USP Schools: FFCLRP; IFSC
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0202148
  • Subjects: ENZIMAS; RECEPTORES; CRISTALOGRAFIA ESTRUTURAL
  • Agências de fomento:
  • Language: Inglês
  • Imprenta:
  • Source:
    • Título do periódico: PLOS ONE
    • ISSN: 1932-6203
    • Volume/Número/Paginação/Ano: v. 13, n. 8, p. e0202148-1- e0202148-16, Aug. 2018
  • Acesso online ao documento

    Online accessDOI or search this record in
    Informações sobre o DOI: 10.1371/journal.pone.0202148 (Fonte: oaDOI API)
    • Este periódico é de acesso aberto
    • Este artigo é de acesso aberto
    • URL de acesso aberto
    • Cor do Acesso Aberto: bronze
    • Licença: cc-by

    How to cite
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      KADOWAKI, Marco A.; VÁRNAI, Anikó; JAMESON, John-Kristian; et al. Functional characterization of a lytic polysaccharide monooxygenase from the thermophilic fungus Myceliophthora thermophila. PLOS ONE, San Francisco, Public Library of Science - PLOS, v. 13, n. 8, p. e0202148-1- e0202148-16, 2018. Disponível em: < http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0202148 > DOI: 10.1371/journal.pone.0202148.
    • APA

      Kadowaki, M. A., Várnai, A., Jameson, J. -K., Leite, A. E. T., Costa Filho, A. J. da, Kumagai, P. S., et al. (2018). Functional characterization of a lytic polysaccharide monooxygenase from the thermophilic fungus Myceliophthora thermophila. PLOS ONE, 13( 8), e0202148-1- e0202148-16. doi:10.1371/journal.pone.0202148
    • NLM

      Kadowaki MA, Várnai A, Jameson J-K, Leite AET, Costa Filho AJ da, Kumagai PS, Prade RA, Polikarpov I, Vincent GHE. Functional characterization of a lytic polysaccharide monooxygenase from the thermophilic fungus Myceliophthora thermophila [Internet]. PLOS ONE. 2018 ; 13( 8): e0202148-1- e0202148-16.Available from: http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0202148
    • Vancouver

      Kadowaki MA, Várnai A, Jameson J-K, Leite AET, Costa Filho AJ da, Kumagai PS, Prade RA, Polikarpov I, Vincent GHE. Functional characterization of a lytic polysaccharide monooxygenase from the thermophilic fungus Myceliophthora thermophila [Internet]. PLOS ONE. 2018 ; 13( 8): e0202148-1- e0202148-16.Available from: http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0202148

    Referências citadas na obra
    Autor: PV Harris
    Título: Stimulation of Lignocellulosic Biomass Hydrolysis by Proteins of Glycoside Hydrolase Family 61: Structure and Function of a Large, Enigmatic Family
    Título do periódico: Biochemistry
    Volume: 49
    Fascículo: 15
    Primeira página: 3305
    Ano: 2010
    DOI: 10.1021/bi100009p
    Autor: G Vaaje-Kolstad
    Título: An Oxidative Enzyme Boosting the Enzymatic Conversion of Recalcitrant Polysaccharides
    Título do periódico: Science
    Volume: 330
    Fascículo: 6001
    Primeira página: 219
    Ano: 2010
    DOI: 10.1126/science.1192231
    Autor: KS Johansen
    Título: Discovery and industrial applications of lytic polysaccharide mono-oxygenases
    Título do periódico: Biochemical Society transactions
    Volume: 44
    Fascículo: 1
    Primeira página: 143
    Ano: 2016
    DOI: 10.1042/BST20150204
    Autor: ET Reese
    Título: The biological degradation of soluble cellulose derivatives and its relationship to the mechanism of cellulose hydrolysis
    Título do periódico: J Bacteriol
    Volume: 59
    Fascículo: 4
    Primeira página: 485
    Ano: 1950
    Autor: KE Eriksson
    Título: Oxidation: an important enzyme reaction in fungal degradation of cellulose
    Título do periódico: FEBS letters
    Volume: 49
    Fascículo: 2
    Primeira página: 282
    Ano: 1974
    DOI: 10.1016/0014-5793(74)80531-4
    Autor: RJ Quinlan
    Título: Insights into the oxidative degradation of cellulose by a copper metalloenzyme that exploits biomass components
    Título do periódico: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
    Volume: 108
    Fascículo: 37
    Primeira página: 15079
    Ano: 2011
    DOI: 10.1073/pnas.1105776108
    Autor: WT Beeson
    Título: Oxidative cleavage of cellulose by fungal copper-dependent polysaccharide monooxygenases
    Título do periódico: J Am Chem Soc
    Volume: 134
    Fascículo: 2
    Primeira página: 890
    Ano: 2012
    DOI: 10.1021/ja210657t
    Autor: Z Forsberg
    Título: Cleavage of cellulose by a CBM33 protein
    Título do periódico: Protein science: a publication of the Protein Society
    Volume: 20
    Fascículo: 9
    Primeira página: 1479
    Ano: 2011
    DOI: 10.1002/pro.689
    Autor: PH Walton
    Título: On the catalytic mechanisms of lytic polysaccharide monooxygenases
    Título do periódico: Current opinion in chemical biology
    Volume: 31
    Primeira página: 195
    Ano: 2016
    DOI: 10.1016/j.cbpa.2016.04.001
    Autor: B Bissaro
    Título: Oxidative cleavage of polysaccharides by monocopper enzymes depends on H2O2
    Título do periódico: Nature chemical biology
    Volume: 13
    Fascículo: 10
    Primeira página: 1123
    Ano: 2017
    DOI: 10.1038/nchembio.2470
    Autor: EA Span
    Título: The framework of polysaccharide monooxygenase structure and chemistry
    Título do periódico: Current opinion in structural biology
    Volume: 35
    Primeira página: 93
    Ano: 2015
    DOI: 10.1016/j.sbi.2015.10.002
    Autor: B Westereng
    Título: Enzymatic cellulose oxidation is linked to lignin by long-range electron transfer
    Título do periódico: Sci Rep
    Volume: 5
    Primeira página: 1
    Ano: 2015
    Autor: M Frommhagen
    Título: Lytic polysaccharide monooxygenases from Myceliophthora thermophila C1 differ in substrate preference and reducing agent specificity
    Título do periódico: Biotechnol Biofuels
    Volume: 9
    Fascículo: 1
    Primeira página: 1
    Ano: 2016
    DOI: 10.1186/s13068-016-0594-y
    Autor: D Kracher
    Título: Extracellular electron transfer systems fuel cellulose oxidative degradation
    Título do periódico: Science
    Primeira página: 1
    Ano: 2016
    Autor: CM Phillips
    Título: Cellobiose dehydrogenase and a copper-dependent polysaccharide monooxygenase potentiate cellulose degradation by Neurospora crassa
    Título do periódico: ACS chemical biology
    Volume: 6
    Fascículo: 12
    Primeira página: 1399
    Ano: 2011
    DOI: 10.1021/cb200351y
    Autor: JA Langston
    Título: Oxidoreductive cellulose depolymerization by the enzymes cellobiose dehydrogenase and glycoside hydrolase 61
    Título do periódico: Appl Environ Microbiol
    Volume: 77
    Fascículo: 19
    Primeira página: 7007
    Ano: 2011
    DOI: 10.1128/AEM.05815-11
    Autor: S Garajova
    Título: Single-domain flavoenzymes trigger lytic polysaccharide monooxygenases for oxidative degradation of cellulose
    Título do periódico: Sci Rep
    Volume: 6
    Primeira página: 1
    Ano: 2016
    DOI: 10.1038/srep28276
    Autor: JS Loose
    Título: Activation of bacterial lytic polysaccharide monooxygenases with cellobiose dehydrogenase
    Título do periódico: Protein science: a publication of the Protein Society
    Volume: 25
    Fascículo: 12
    Primeira página: 2175
    Ano: 2016
    DOI: 10.1002/pro.3043
    Autor: VV Vu
    Título: Determinants of regioselective hydroxylation in the fungal polysaccharide monooxygenases
    Título do periódico: J Am Chem Soc
    Volume: 136
    Fascículo: 2
    Primeira página: 562
    Ano: 2014
    DOI: 10.1021/ja409384b
    Autor: A Villares
    Título: Lytic polysaccharide monooxygenases disrupt the cellulose fibers structure
    Título do periódico: Sci Rep
    Volume: 7
    Primeira página: 1
    Ano: 2017
    DOI: 10.1038/srep40262
    Autor: M Eibinger
    Título: Cellulose surface degradation by a lytic polysaccharide monooxygenase and its effect on cellulase hydrolytic efficiency
    Título do periódico: The Journal of biological chemistry
    Volume: 289
    Fascículo: 52
    Primeira página: 35929
    Ano: 2014
    DOI: 10.1074/jbc.M114.602227
    Autor: V Lombard
    Título: The carbohydrate-active enzymes database (CAZy) in 2013
    Título do periódico: Nucleic Acids Res
    Volume: 42
    Primeira página: D490
    Ano: 2014
    DOI: 10.1093/nar/gkt1178
    Autor: JW Agger
    Título: Discovery of LPMO activity on hemicelluloses shows the importance of oxidative processes in plant cell wall degradation
    Título do periódico: Proc Natl Acad Sci U S A
    Volume: 111
    Fascículo: 17
    Primeira página: 6287
    Ano: 2014
    DOI: 10.1073/pnas.1323629111
    Autor: T Isaksen
    Título: A C4-oxidizing lytic polysaccharide monooxygenase cleaving both cellulose and cello-oligosaccharides
    Título do periódico: The Journal of biological chemistry
    Volume: 289
    Fascículo: 5
    Primeira página: 2632
    Ano: 2014
    DOI: 10.1074/jbc.M113.530196
    Autor: N Lenfant
    Título: A bioinformatics analysis of 3400 lytic polysaccharide oxidases from family AA9
    Título do periódico: Carbohydr Res
    Volume: 448
    Primeira página: 166
    Ano: 2017
    DOI: 10.1016/j.carres.2017.04.012
    Autor: RM Berka
    Título: Comparative genomic analysis of the thermophilic biomass-degrading fungi Myceliophthora thermophila and Thielavia terrestris
    Título do periódico: Nature biotechnology
    Volume: 29
    Fascículo: 10
    Primeira página: 922
    Ano: 2011
    DOI: 10.1038/nbt.1976
    Autor: M Frommhagen
    Título: Quantification of the catalytic performance of C1-cellulose-specific lytic polysaccharide monooxygenases
    Título do periódico: Appl Microbiol Biotechnol
    Volume: 102
    Fascículo: 3
    Primeira página: 1281
    Ano: 2018
    DOI: 10.1007/s00253-017-8541-9
    Autor: TJ Simmons
    Título: Structural and electronic determinants of lytic polysaccharide monooxygenase reactivity on polysaccharide substrates
    Título do periódico: Nature communications
    Volume: 8
    Fascículo: 1
    Primeira página: 1
    Ano: 2017
    DOI: 10.1038/s41467-017-01247-3
    Autor: KE Frandsen
    Título: Unliganded and substrate bound structures of the cellooligosaccharide active lytic polysaccharide monooxygenase LsAA9A at low pH
    Título do periódico: Carbohydr Res
    Ano: 2017
    Autor: RC Edgar
    Título: MUSCLE: a multiple sequence alignment method with reduced time and space complexity
    Título do periódico: BMC bioinformatics
    Volume: 5
    Primeira página: 113
    Ano: 2004
    DOI: 10.1186/1471-2105-5-113
    Autor: K Tamura
    Título: MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0
    Título do periódico: Molecular biology and evolution
    Volume: 30
    Fascículo: 12
    Primeira página: 2725
    Ano: 2013
    DOI: 10.1093/molbev/mst197
    Autor: C Notredame
    Título: T-Coffee: A novel method for fast and accurate multiple sequence alignment
    Título do periódico: J Mol Biol
    Volume: 302
    Fascículo: 1
    Primeira página: 205
    Ano: 2000
    DOI: 10.1006/jmbi.2000.4042
    Autor: M Biasini
    Título: SWISS-MODEL: modelling protein tertiary and quaternary structure using evolutionary information
    Título do periódico: Nucleic Acids Res
    Volume: 42
    Primeira página: W252
    Ano: 2014
    DOI: 10.1093/nar/gku340
    Autor: AS Borisova
    Título: Structural and Functional Characterization of a Lytic Polysaccharide Monooxygenase with Broad Substrate Specificity
    Título do periódico: The Journal of biological chemistry
    Volume: 290
    Fascículo: 38
    Primeira página: 22955
    Ano: 2015
    DOI: 10.1074/jbc.M115.660183
    Autor: KE Frandsen
    Título: The molecular basis of polysaccharide cleavage by lytic polysaccharide monooxygenases
    Título do periódico: Nature chemical biology
    Primeira página: 1
    Ano: 2016
    Autor: HB Dos Santos
    Título: Myceliophthora thermophila M77 utilizes hydrolytic and oxidative mechanisms to deconstruct biomass
    Título do periódico: AMB Express
    Volume: 6
    Fascículo: 1
    Primeira página: 1
    Ano: 2016
    DOI: 10.1186/s13568-016-0276-y
    Autor: F Segato
    Título: High-yield secretion of multiple client proteins in Aspergillus
    Título do periódico: Enzyme Microb Technol
    Volume: 51
    Fascículo: 2
    Primeira página: 100
    Ano: 2012
    DOI: 10.1016/j.enzmictec.2012.04.008
    Autor: C Aslanidis
    Título: Ligation-independent cloning of PCR products (LIC-PCR)
    Título do periódico: Nucleic Acids Res
    Volume: 18
    Fascículo: 20
    Primeira página: 6069
    Ano: 1990
    DOI: 10.1093/nar/18.20.6069
    Autor: E Gasteiger
    Título: Protein Identification and Analysis Tools on the ExPASy Server
    Ano: 2005
    Autor: UK Laemmli
    Título: Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4
    Título do periódico: Nature
    Volume: 227
    Fascículo: 5259
    Primeira página: 680
    Ano: 1970
    DOI: 10.1038/227680a0
    Autor: MO Arntzen
    Título: Outer membrane vesicles from Fibrobacter succinogenes S85 contain an array of carbohydrate-active enzymes with versatile polysaccharide-degrading capacity
    Título do periódico: Environmental microbiology
    Volume: 19
    Fascículo: 7
    Primeira página: 2701
    Ano: 2017
    DOI: 10.1111/1462-2920.13770
    Autor: K Huynh
    Título: Analysis of protein stability and ligand interactions by thermal shift assay
    Título do periódico: Curr Protoc Protein Sci
    Volume: 79
    Primeira página: 28 9 1
    Ano: 2015
    DOI: 10.1002/0471140864.ps2809s79
    Autor: TM Wood
    Título: Methods in Enzymology
    Volume: 160
    Primeira página: 19
    Ano: 1988
    Autor: B Westereng
    Título: Efficient separation of oxidized cello-oligosaccharides generated by cellulose degrading lytic polysaccharide monooxygenases
    Título do periódico: Journal of chromatography A
    Volume: 1271
    Fascículo: 1
    Primeira página: 144
    Ano: 2013
    DOI: 10.1016/j.chroma.2012.11.048
    Autor: TN Petersen
    Título: SignalP 4.0: discriminating signal peptides from transmembrane regions
    Título do periódico: Nat Methods
    Volume: 8
    Fascículo: 10
    Primeira página: 785
    Ano: 2011
    DOI: 10.1038/nmeth.1701
    Autor: M Wu
    Título: Crystal structure and computational characterization of the lytic polysaccharide monooxygenase GH61D from the Basidiomycota fungus Phanerochaete chrysosporium
    Título do periódico: The Journal of biological chemistry
    Volume: 288
    Fascículo: 18
    Primeira página: 12828
    Ano: 2013
    DOI: 10.1074/jbc.M113.459396
    Autor: G Courtade
    Título: Interactions of a fungal lytic polysaccharide monooxygenase with beta-glucan substrates and cellobiose dehydrogenase
    Título do periódico: Proc Natl Acad Sci U S A
    Primeira página: 1
    Ano: 2016
    Autor: Z Forsberg
    Título: Structural and functional characterization of a conserved pair of bacterial cellulose-oxidizing lytic polysaccharide monooxygenases
    Título do periódico: Proc Natl Acad Sci U S A
    Volume: 111
    Fascículo: 23
    Primeira página: 8446
    Ano: 2014
    DOI: 10.1073/pnas.1402771111
    Autor: Z Forsberg
    Título: Structural determinants of bacterial lytic polysaccharide monooxygenase functionality
    Título do periódico: The Journal of biological chemistry
    Volume: 293
    Fascículo: 4
    Primeira página: 1397
    Ano: 2018
    DOI: 10.1074/jbc.M117.817130
    Autor: B Westereng
    Título: Simultaneous analysis of C1 and C4 oxidized oligosaccharides, the products of lytic polysaccharide monooxygenases acting on cellulose
    Título do periódico: Journal of chromatography A
    Volume: 1445
    Primeira página: 46
    Ano: 2016
    DOI: 10.1016/j.chroma.2016.03.064
    Autor: C Bennati-Granier
    Título: Substrate specificity and regioselectivity of fungal AA9 lytic polysaccharide monooxygenases secreted by Podospora anserina
    Título do periódico: Biotechnol Biofuels
    Volume: 8
    Primeira página: 90
    Ano: 2015
    DOI: 10.1186/s13068-015-0274-3
    Autor: B Bissaro
    Título: Fenton-type chemistry by a copper enzyme: molecular mechanism of polysaccharide oxidative cleavage
    Título do periódico: bioRxiv
    Primeira página: 1
    Ano: 2016
    Autor: J Hangasky
    Título: A random-sequential kinetic mechanism for polysaccharide monooxygenases
    Título do periódico: Biochemistry
    Primeira página: 1
    Ano: 2018
    Autor: JA Hangasky
    Título: Reactivity of O2 versus H2O2 with polysaccharide monooxygenases
    Título do periódico: Proc Natl Acad Sci U S A
    Primeira página: 1
    Ano: 2018