Association of predicted deleterious single nucleotide polymorphisms with carcass traits in meat-type chickens (2018)
- Authors:
- Autor USP: TREVISOLI, PRISCILA ANCHIETA - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LZT
- Subjects: CARCAÇA; FRANGOS DE CORTE; GENÔMICA; MARCADOR MOLECULAR; POLIMORFISMO; SEQUÊNCIA DO DNA
- Language: Inglês
- Abstract: O melhoramento genético é o principal responsável pelo aumento da eficiência da produção avícola nas últimas décadas e os programas de melhoramento de aves estão direcionados para um maior rendimento de carne e eficiência alimentar. Dentre as abordagens genômicas, estudos de associação genômica ampla (GWAS) identificaram loci associados com características quantitativas (QTLs) de carcaça em uma população de frangos de corte. Análise de GWAS identifica regiões em desequilíbrio de ligação com possíveis mutações causais e com o objetivo de refinar esses resultados, estudos de associações usando polimorfismos de base única (SNPs) não sinônimos podem ser úteis. O SNP não sinônimo pode ser predito como deletério por meio do Sorting Intolerant From Tolerant (SIFT) score quando a alteração de aminoácidos tem o potencial de impactar a função da proteína e consequentemente pode afetar o fenótipo. Portanto, neste estudo, SNPs preditos como deletérios localizados em regiões de QTLs foram identificados e associados com peso e rendimento de coxa, sobrecoxa, gordura abdominal e peito de frangos de corte. Modelo misto foi utilizado, com sexo, incubação e genótipos dos SNPs como efeitos fixos e família como efeito aleatório. De 20 SNPs analisados, seis foram associados significativamente (p<0,05) com peso e rendimento de coxa, sobrecoxa e peito, e três deles rs736010549, rs739508259 e rs313532967 estão presentes nos genes WDR77, VWA8 e BARL, respectivamente. Estes genes estão relacionados com processos biológicos como via de sinalização de esteroide, receptores de estrogênio e de ácidos biliares. Nossa estratégia permitiu a identificação de potenciais mutações causais associadas com crescimento e desenvolvimento muscular.
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2018
- Data da defesa: 11.05.2018
-
ABNT
TREVISOLI, Priscila Anchieta. Association of predicted deleterious single nucleotide polymorphisms with carcass traits in meat-type chickens. 2018. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2018. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-21082018-152925/. Acesso em: 16 abr. 2024. -
APA
Trevisoli, P. A. (2018). Association of predicted deleterious single nucleotide polymorphisms with carcass traits in meat-type chickens (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-21082018-152925/ -
NLM
Trevisoli PA. Association of predicted deleterious single nucleotide polymorphisms with carcass traits in meat-type chickens [Internet]. 2018 ;[citado 2024 abr. 16 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-21082018-152925/ -
Vancouver
Trevisoli PA. Association of predicted deleterious single nucleotide polymorphisms with carcass traits in meat-type chickens [Internet]. 2018 ;[citado 2024 abr. 16 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-21082018-152925/ - Bovine milk microbiota: molecular characterization and evaluation of mastitis pathogens detection methodologies
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