Incorporação de evidências biológicas para a identificação de SNPs interferindo em sítios alvos de miRNAs (2018)
- Authors:
- Autor USP: OLIVEIRA, PAULA PRIETO - BIOINFORMÁTICA
- Unidade: BIOINFORMÁTICA
- Subjects: BIOINFORMÁTICA; MICRORNAS
- Keywords: Interferência de SNPs; MicroRNAs sites; Sítios de microRNAs; SNPs interference
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: SIMTar (SNPs Interfering in MicroRNA Targets) é uma ferramenta computacional que realiza a predição de interferência de SNPs em sítios alvos de miRNAs. Dada uma lista de SNPs, SIMTar analisa uma janela ao redor de cada SNP e verifica se tal SNP cria ou rompe um sítio de miRNA utilizando como base programas de predição de sítios de miRNAs nos vários alelos desta janela. Se o resultado da predição para um dado miRNA é diferente para diferentes alelos, então tal SNP está potencialmente interferindo em tal sítio. O presente trabalho teve como objetivo melhorar o processo de identificação de interferência de SNPs em sítios alvos de miRNAs, usando um novo programa de predição de sítios de miRNAs, assim como a incorporação de resultados biológicos experimentais. A hipótese deste trabalho é que com estas modificações poderia-se diminuir a expectativa de falsos positivos sem diminuir a sensibilidade. Os resultados obtidos validam a hipótese e ainda mostram que o SIMTar possui vantagens quando comparado com outras ferramentas ou bancos de dados de propósito similar
- Imprenta:
- Data da defesa: 10.12.2018
-
ABNT
OLIVEIRA, Paula Prieto. Incorporação de evidências biológicas para a identificação de SNPs interferindo em sítios alvos de miRNAs. 2018. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2018. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-13012019-200435/. Acesso em: 16 abr. 2024. -
APA
Oliveira, P. P. (2018). Incorporação de evidências biológicas para a identificação de SNPs interferindo em sítios alvos de miRNAs (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-13012019-200435/ -
NLM
Oliveira PP. Incorporação de evidências biológicas para a identificação de SNPs interferindo em sítios alvos de miRNAs [Internet]. 2018 ;[citado 2024 abr. 16 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-13012019-200435/ -
Vancouver
Oliveira PP. Incorporação de evidências biológicas para a identificação de SNPs interferindo em sítios alvos de miRNAs [Internet]. 2018 ;[citado 2024 abr. 16 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-13012019-200435/
How to cite
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
