Elucidating the molecular machinery of an evolutionary novelty: single-cell transcriptomics of Arcella intermedia and characterization of gene expression during shell formation (2019)
- Authors:
- Autor USP: SOUSA, ALFREDO LEONARDO PORFIRIO DE - IB
- Unidade: IB
- Sigla do Departamento: BIZ
- Subjects: ZOOLOGIA (CLASSIFICAÇÃO); AMOEBA; EVOLUÇÃO; BIOLOGIA MOLECULAR; EXPRESSÃO GÊNICA; CONCHAS (ZOOLOGIA)
- Keywords: Amoebozoa; Amoebozoa; Arcellinida; Arcellinida; Evolutionary novelty; Modelo molecular; Molecular model; Novidade evolutiva; Rab GTPase; Rab GTPases; Tecagênese; Thecagenesis
- Agências de fomento:
- Language: Inglês
- Abstract: A presente dissertação tem como objetivo lançar luz sobre a maquinaria molecular envolvida no processo de formação de teca (tecagênese) em textit (Arcellinida: Amoebozoa). Arcellinida são amebas tecadas unicelulares, caracterizadas pela presença de uma teca (carapaça ou concha) externa; é uma linhagem monofilética de Amoebozoa, grupo irmão de alguns organismos amebóides nus. Nenhuma estrutura homóloga à carapaça está presente no grupo irmão de Arcellinida, sendo considerada como uma novidade evolutiva. A origem e evolução da carapaça em Arcellinida são questões em aberto; Decifrar seu processo de formação é um passo fundamental para abordar essas questões. Durante todo processo reprodutivo, por divisão por brotamento, estes organismo constroem uma nova concha. No decorrer de mais de um século, vários autores descreveram o processo de tecagênese nestes organismos, focando principalmente no gênero textit, baseados em evidências cito-morfológicas. Enquanto isso, a ausência de dados moleculares impede avanços na descrição dos aspectos moleculares da formação de conchas. Neste estudo, projetamos e aplicamos uma textit molecular para identificar genes candidatos e desenvolver um modelo molecular para o processo de formação de teca em textit; Baseamos este textit em sequenciamento de RNA textit, perfil de expressão gênica, análise de textit{Gene Ontology} e análise comparativa de dados cito-morfológicos e moleculares. Nós identificamos e propomos um conjunto de 539genes como genes candidatos para a formação de carapaça, com base no perfil de expressão e na atribuição de processos biológica. Propomos um modelo para o processo de formação de carapaça, que descreve o aspecto mecanicista deste processo, hipoteticamente baseado em um mecanismo molecular conservado em Eucariotos. Além disso, identificamos uma expansão maciça da família gênica das Rab GTPase, gene provavelmente envolvida no processo de formação de carapaça. À luz do presente estudo, discutimos brevemente possíveis cenários evolutivos envolvidos na origem e evolução da teca e apresentamos perspectivas futuras; propomos a teca dos Arcellinida como próspero modelo para estudar a origem e evolução das novidades evolutivas, bem como outras questões evolutivas
- Imprenta:
- Data da defesa: 14.02.2019
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ABNT
SOUSA, Alfredo Leonardo Porfirio de. Elucidating the molecular machinery of an evolutionary novelty: single-cell transcriptomics of Arcella intermedia and characterization of gene expression during shell formation. 2019. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2019. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41133/tde-07052019-101649/. Acesso em: 23 abr. 2024. -
APA
Sousa, A. L. P. de. (2019). Elucidating the molecular machinery of an evolutionary novelty: single-cell transcriptomics of Arcella intermedia and characterization of gene expression during shell formation (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41133/tde-07052019-101649/ -
NLM
Sousa ALP de. Elucidating the molecular machinery of an evolutionary novelty: single-cell transcriptomics of Arcella intermedia and characterization of gene expression during shell formation [Internet]. 2019 ;[citado 2024 abr. 23 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41133/tde-07052019-101649/ -
Vancouver
Sousa ALP de. Elucidating the molecular machinery of an evolutionary novelty: single-cell transcriptomics of Arcella intermedia and characterization of gene expression during shell formation [Internet]. 2019 ;[citado 2024 abr. 23 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41133/tde-07052019-101649/ - Deconstructing difflugia: the tangled evolution of lobose testate amoebae shells (Amoebozoa: Arcellinida) illustrates the importance of convergent evolution in protist phylogeny
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