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Mapeamento de epitopos para células B de bovinos em antígenos de carrapatos: Uma análise comparativa entre métodos in silico e in vitro (2019)

  • Authors:
  • USP affiliated authors: ALMEIDA, LUIZ GUSTAVO NOGUEIRA DE - FMRP
  • USP Schools: FMRP
  • Sigla do Departamento: RBI
  • Subjects: IMUNOLOGIA; EPITOPOS; BIOINFORMÁTICA; CARRAPATOS; VACINAS
  • Agências de fomento:
  • Language: Português
  • Abstract: ajuste dos parâmetros utilizados na predição, visto que a sua otimização pode resultar em uma análise mais acurada pelas ferramentas de bioinformática. No entanto, com a atual metodologia, as ferramentas in silico são úteis para a exclusão de sequências que não são características de epitopos. Essa abordagem pode ser utilizada para a identificação restrição de regiões dos antígenos com pouca antigenicidade predita, estratégia que pode reduzir o número de sequências a serem avaliadas como candidatos vacinais e também facilitar a construção de vacinas multi-antigênicasCarrapatos são os mais importantes vetares para a transmissão de doenças para bovinos, e por isso o controle eficiente das infestações é de grande interesse. Vacinas multi-antigênicas baseadas em antígenos recombinantes salivares tem demonstrado boa atividade anti-carrapatos, mas seu desenvolvimento é complexo. Este processo pode ser facilitado pelo uso de ferramentas in silico para a predição de epitopos em antígenos de interesse. No entanto, não há dados disponíveis sobre a utilidade destes métodos, construídos com bases de dados humanas e murinas, para a identificação de epitopos reconhecidos por anticorpos bovinos. Neste trabalho, nós investigamos em antígenos de carrapatos se há uma correspondência entre a predição in silico e o mapeamento in vitro de epitopos para células B. Para tal, nós submetemos nove sequências proteicas de antígenos presentes na saliva do carrapatos Rhipicephalus microplus à modelagem tridimensional e predição de epitopos contínuos e descontínuos pelas ferramentas Bebipred e Epitopia, respectivamente. Concomitantemente, nós imunizamos bovinos com os mesmos antígenos recombinantes para a produção de soro hiperimune ao pool de antígenos, e verificamos a reatividade deste soro com mimotopos identificados por phage display utilizado IgY-antigeno especifico no biopanning. As predições bioinformáticas indicaram a ocorrência de 46% a 94% de aminoácidos antigênicos nas sequências analisadas, enquanto que o mapeamento in vitro identificou cerca de 20% a 42% de aminoácidos antigênicos para os diferentes antígenos. Ao sobrepor os resultados obtidos, observamos que as técnicas in silico foram capazes de prever até 92% dos epitopos mapeados in vitro, mas esse alto valor está diretamente associado à superestimação no número de aminoácidos imunogênicos nas análises de bioinformática. Dessa forma, torna-se necessário o
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 30.04.2019

  • How to cite
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    • ABNT

      ALMEIDA, Luiz Gustavo Nogueira de; SANTOS, Isabel Kinney Ferreira de Miranda; FERREIRA, Beatriz Rossetti. Mapeamento de epitopos para células B de bovinos em antígenos de carrapatos: Uma análise comparativa entre métodos in silico e in vitro. 2019.Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2019.
    • APA

      Almeida, L. G. N. de, Santos, I. K. F. de M., & Ferreira, B. R. (2019). Mapeamento de epitopos para células B de bovinos em antígenos de carrapatos: Uma análise comparativa entre métodos in silico e in vitro. Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto.
    • NLM

      Almeida LGN de, Santos IKF de M, Ferreira BR. Mapeamento de epitopos para células B de bovinos em antígenos de carrapatos: Uma análise comparativa entre métodos in silico e in vitro. 2019 ;
    • Vancouver

      Almeida LGN de, Santos IKF de M, Ferreira BR. Mapeamento de epitopos para células B de bovinos em antígenos de carrapatos: Uma análise comparativa entre métodos in silico e in vitro. 2019 ;

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