Evaluation of software to construct genetic linkage maps in plants (2019)
- Authors:
- Autor USP: SANTOS, JENIFER CAMILA GODOY DOS - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LGN
- Subjects: MAPEAMENTO GENÉTICO; MELHORAMENTO GENÉTICO VEGETAL; PLANTAS CULTIVADAS; SOFTWARE LIVRE
- Language: Inglês
- Abstract: Mapas genéticos são ferramentas úteis em programas de melhoramento e em estudos evolutivos. Desde a publicação do primeiro mapa, vários conceitos foram propostos e implementados em vários softwares de mapeamento. Cada software apresenta diferentes características para construção de mapas. Por exemplo, aspectos como disponibilidade do código fonte, licenças, tutoriais e sistema operacional precisam ser considerados. Há ainda pontos importantes relacionados aos métodos estatísticos empregados. Assim sendo, nem sempre a escolha pelos usuários é uma tarefa simples. Os objetivos aqui foram: i) apresentar os principais softwares com licenças gratuitas desenvolvidos nos últimos anos; ii) construir mapas de ligação utilizando esses programas e iii) avaliá-los do ponto de vista dos usuários. Os softwares considerados foram: OneMap, Lep-MAP, HighMap, Lep-MAP2, Flipper, Lep-MAP3, ASMap e GUSMap. Este trabalho poderá orientar os pesquisadores quanto às ferramentas gratuitas disponíveis para construção de mapas genéticos
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2019
- Data da defesa: 04.07.2019
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ABNT
SANTOS, Jenifer Camila Godoy dos. Evaluation of software to construct genetic linkage maps in plants. 2019. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2019. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-28082019-142400/. Acesso em: 24 abr. 2024. -
APA
Santos, J. C. G. dos. (2019). Evaluation of software to construct genetic linkage maps in plants (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-28082019-142400/ -
NLM
Santos JCG dos. Evaluation of software to construct genetic linkage maps in plants [Internet]. 2019 ;[citado 2024 abr. 24 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-28082019-142400/ -
Vancouver
Santos JCG dos. Evaluation of software to construct genetic linkage maps in plants [Internet]. 2019 ;[citado 2024 abr. 24 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-28082019-142400/
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