Tese

Microbial communities and functional genes involved in nutrient cycling of Pantanal of Nhecolândia MS (2022)

• Authors:
  • Pellegrinetti, Thierry Alexandre
  • Fiore, Marli de Fatima (Orientador)
• Autor USP: PELLEGRINETTI, THIERRY ALEXANDRE - CENA
• Unidade: CENA
• DOI: 10.11606/T.64.2022.tde-29092022-155448
• Subjects: BACTÉRIAS; BIOINFORMÁTICA; CARBONO; CICLOS BIOGEOQUÍMICOS; DADOS DE SEQUÊNCIA MOLECULAR; ECOLOGIA MICROBIANA; LIMNOLOGIA; NITROGÊNIO
• Keywords: Biogeochemical cycles; Ciclos biogeoquímicos; Cyanobacterial blooms; Florações de cianobactéria; Metagenomic; Metagenômica; Microbial ecology
• Agências de fomento:
  • Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
• Language: Inglês
• Abstract: A Nhecolândia (MS), uma importante sub-região do Pantanal, é composta por 12.150 mil lagoas dentre as quais aproximadamente 600 lagoas podem ser descritas como salino alcalinas (soda lakes). As lagoas salino alcalinas apresentam altas concentrações de carbonatos e bicarbonatos de sódio, resultando em altos valores de pH (acima de 9) e salinidade (até 35 mS cm-1). Mesmo apresentando condições consideradas extremas, este ecossistema possui uma rica biodiversidade de microrganismos. Neste trabalho, foram adotadas estratégias que combinaram análises moleculares e químicas com o objetivo de avaliar a composição (taxonômica e funcional) e o estilo de vida das comunidades bacterianas nas águas superficiais deste ambiente. Por meio de análises de ordenação utilizando dados limnológicos e metagenômicos, foi possível agrupar as lagoas salino alcalinas avaliadas em três perfis distintos: túrbidas eutróficas (ET), túrbidas oligotróficas (OT) e cristalinas oligotróficas vegetadas (CVO). Um fator preponderante na dinâmica da comunidade bacteriana foi a sazonalidade. Durante a estação seca, o nível da água reduziu consideravelmente devido a intensos períodos de evaporação, levando a um aumento nos níveis de salinidade, pH e concentração de nutrientes, o que por sua vez aumentou a diversidade e a abundância relativa dos microrganismos. Esse cenário propiciou a ocorrência de florações de cianobactérias nas lagoas ET, principalmente associadas aos táxons Arthrospira platensis ou Anabaenopsiselenkinii. Essa predominância pode ser justificada pelo investimento por mecanismos de aquisição de nutrientes por esses organismos. Nas lagoas OT e CVO houve uma predominância de Actinobacteria, Alphaproteobacteria e Betaproteobacteria e esses organismos possivelmente adotaram estratégias associadas a captação de nutrientes. É interessante observar que os genes de aquisição de nutrientes foram predominantes nas lagoas ET, com elevada abundância relativa de genes associados a fixação biológica de CO2, N2, fosfatase alcalina e redução de sulfato. Em lagoas OT e CVO, observamos uma baixa ocorrência de genes associados a nitrificação e metanogênese enquanto genes associados a redução de nitratos e nitritos, e a desnitrificação foram mais abundantes. Em condições oligotróficas genes relacionados com o transporte de fosfato, a regulação de fósforo como também a oxidação de sulfeto e tiossulfato foram abundantes. Ao todo, este estudo desvenda a diversidade taxonômica e funcional em lagoas salino alcalinas tropicais, como também explora como os microrganismos se comportam em condições ambientais distintas. Além disso, este estudo servirá como ponto de partida para as práticas de manejo e medidas de conservação da biodiversidade do Pantanal
• Imprenta:
  • Publisher place: Piracicaba
  • Date published: 2022
• Data da defesa: 26.07.2022

Informações sobre o DOI: 10.11606/T.64.2022.tde-29092022-155448 (Fonte: oaDOI API)
• Este periódico é de acesso aberto
• Este artigo é de acesso aberto
• URL de acesso aberto
• Cor do Acesso Aberto: gold
• Licença: cc-by-nc-sa

---

How to cite

A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

• ABNT

  PELLEGRINETTI, Thierry Alexandre. Microbial communities and functional genes involved in nutrient cycling of Pantanal of Nhecolândia MS. 2022. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-29092022-155448/. Acesso em: 02 jun. 2024.

• APA

  Pellegrinetti, T. A. (2022). Microbial communities and functional genes involved in nutrient cycling of Pantanal of Nhecolândia MS (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-29092022-155448/

• NLM

  Pellegrinetti TA. Microbial communities and functional genes involved in nutrient cycling of Pantanal of Nhecolândia MS [Internet]. 2022 ;[citado 2024 jun. 02 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-29092022-155448/

• Vancouver

  Pellegrinetti TA. Microbial communities and functional genes involved in nutrient cycling of Pantanal of Nhecolândia MS [Internet]. 2022 ;[citado 2024 jun. 02 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-29092022-155448/

Últimas obras dos mesmos autores vinculados com a USP cadastradas na BDPI:

• Bioaccumulation and speciation of arsenic in plankton from tropical soda lakes along a salinity gradient
• Disentangling the lifestyle of bacterial communities in tropical soda lakes
• Phylogenomic analysis of Anabaenopsis elenkinii (Nostocales, Cyanobacteria)
• Bacterial Communities Along Environmental Gradients in Tropical Soda Lakes
• Draft genome sequences of representative Paenibacillus polymyxa, Bacillus cereus Fictibacillus sp., and Brevibacillus agri strains isolated from Amazonian dark earth
• Genomic insights of Fictibacillus terranigra sp. nov., a versatile metabolic bacterium from Amazonian Dark Earths
• The interplay between the inoculation of plant growth-promoting rhizobacteria and the rhizosphere microbiome and their impact on plant phenotype