Tese

Modelagem estatística e desenvolvimento de ferramentas computacionais aplicados à produção in vitro de embriões bovinos e hormesis em plantas (2023)

• Authors:
  • Amorim, Deoclecio Jardim
  • Demetrio, Clarice Garcia Borges (Orientador)
• Autor USP: AMORIM, DEOCLECIO JARDIM - ESALQ
• Unidade: ESALQ
• Sigla do Departamento: LCE
• DOI: 10.11606/T.11.2023.tde-10072023-095931
• Subjects: BOVINOS; EMBRIÃO DE ANIMAL; MODELAGEM DE DADOS; MODELOS LINEARES GENERALIZADOS; MODELOS NÃO LINEARES; PLANTAS CULTIVADAS; R (SOFTWARE ESTATÍSTICO)
• Keywords: Hormesis; Superdispersão
• Agências de fomento:
  • Financiamento CAPES
• Language: Português
• Abstract: Dados provenientes de estudos em ciências agrárias podem apresentar características diferentes, com destaque para estudos de produção in vitro apresentam distribuição normal e são medidos em contextos longitudinais ou hierárquicos. Exemplos comuns incluem dados na forma de contagens, proporções e binários. Por outro lado, na maioria dos estudos de hormesis, os dados são correlacionados, presentes em características morfológicas, fisiológicas e bioquímicas. Nesse sentido, o objetivo deste trabalho é desenvolver modelos e ferramentas computacionais que auxiliem na análise desses tipos de dados, tornando-a mais acessível a pesquisadores de áreas aplicadas. Em relação aos dados da PIVE, inicialmente, abordaram-se os aspectos relacionados a superdispersão e correlação em dados longitudinais, testes de hipóteses sobre os componentes de variância e seleção de modelos com foco em dados na forma de contagens e na proposição de um tutorial utilizando o software R. Os modelos lineares generalizados mistos (MLGMs) e os modelos combinados (MC) ajustaram-se satisfatoriamente, captando a variabilidade extra e a correlação entre as medidas longitudinais. O MC tem como característica o uso de dois conjuntos de efeitos aleatórios para capturar a superdispersão e a correlação, sendo mais flexíveis que os tradicionais MLGMs. Apesar da flexibilidade de modelagem oferecida, os MCs ainda não possuem uma ferramenta computacional padronizada no software de código-aberto R. Em função disso, foidesenvolvido o pacote combTMB para o software R. As funcionalidades do pacote são ilustradas com duas aplicações em dados na forma de contagens e de proporções. Finalmente, foi proposta uma modelagem não linear multivariada para estudar hormesis em plantas, sendo que as informações concernentes às correlações das variáveis respostas são consideradas com uma matriz de variâncias e covariâncias obtida, a partir dos resíduos univariados. Uma vantagem dessa estratégia de modelagem é a obtenção de estimativas mais precisas dos parâmetros e uma maior compreensão das relações bifásicas de dose-resposta, pois considera na estrutura de modelagem as inter-relações existentes entre as diversas características mensuradas no sistema vegetal
• Imprenta:
  • Publisher place: Piracicaba
  • Date published: 2023
• Data da defesa: 06.06.2023

Informações sobre o DOI: 10.11606/T.11.2023.tde-10072023-095931 (Fonte: oaDOI API)
• Este periódico é de acesso aberto
• Este artigo é de acesso aberto
• URL de acesso aberto
• Cor do Acesso Aberto: gold
• Licença: cc-by-nc-sa

---

How to cite

A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

• ABNT

  AMORIM, Deoclecio Jardim. Modelagem estatística e desenvolvimento de ferramentas computacionais aplicados à produção in vitro de embriões bovinos e hormesis em plantas. 2023. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2023. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11134/tde-10072023-095931/. Acesso em: 10 jun. 2024.

• APA

  Amorim, D. J. (2023). Modelagem estatística e desenvolvimento de ferramentas computacionais aplicados à produção in vitro de embriões bovinos e hormesis em plantas (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11134/tde-10072023-095931/

• NLM

  Amorim DJ. Modelagem estatística e desenvolvimento de ferramentas computacionais aplicados à produção in vitro de embriões bovinos e hormesis em plantas [Internet]. 2023 ;[citado 2024 jun. 10 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11134/tde-10072023-095931/

• Vancouver

  Amorim DJ. Modelagem estatística e desenvolvimento de ferramentas computacionais aplicados à produção in vitro de embriões bovinos e hormesis em plantas [Internet]. 2023 ;[citado 2024 jun. 10 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11134/tde-10072023-095931/

Últimas obras dos mesmos autores vinculados com a USP cadastradas na BDPI:

• Glyphosate hormesis mitigates the effect of water deficit in safflower ( Carthamus tinctorius L.)
• The use of the generalized linear model to assess the speed and uniformity of germination of corn and soybean seeds
• Glyphosate hormesis attenuates water deficit stress in safflower (Carthamus tinctorius L.) by modulating physiological and biochemical mediators
• Modeling hormesis using multivariate nonlinear regression in plant biology: a comprehensive approach to understanding dose-response relationships
• Biology and quality assessment of Telenomus remus (Hymenoptera: Scelionidae) and Trichogramma spp. (Hymenoptera: Trichogrammatidae) in eggs of Spodoptera spp. for augmentative biological control programs
• Potential of thaxtomin A for the control of the Asian soybean rust
• Biological basis for adoption of an isoline of Telenomus remus (Hymenoptera: Scelionidae) for an augmentative biological-control program for Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae)