Tese

Identificação de potenciais biomarcadores epigenéticos em ependimomas supratentoriais (2023)

• Authors:
  • Sousa, Graziella Ribeiro de
  • Tone, Luiz Gonzaga (Orientador)
  • Xavier, Karina Bezerra Salomão (coorient)
• Autor USP: SOUSA, GRAZIELLA RIBEIRO DE - FMRP
• Unidade: FMRP
• Sigla do Departamento: RGE
• DOI: 10.11606/T.17.2023.tde-08082023-141956
• Subjects: NEOPLASIAS DO SISTEMA NERVOSO; METILAÇÃO DE DNA; CARCINOGÊNESE; BIOMARCADORES
• Keywords: DNA methylation; Ependimoma; Ependimoma supratentorial; Ependymoma; Histonas desacetilases; Histone deacetylases; ST-ZFTA; Supratentorial ependymoma
• Agências de fomento:
  • Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
    Processo FAPESP: 2014/20341-0
  • Financiamento CNPq
  • Financiamento CAPES
• Language: Português
• Abstract: O ependimoma (EPN) é o terceiro tumor do sistema nervoso central mais comum em crianças. Atualmente é subdivido em dez subgrupos moleculares, sendo os EPNs supratentoriais (ST) (YAP1 e ZFTA) e fossa posterior Grupo A (FPA) os mais prevalentes na infância. O subgrupo ST-ZFTA corresponde a cerca de 70% dos EPNs-ST e tem o pior prognóstico clínico. Modificações epigenéticas contribuem para o desenvolvimento e progressão dos tumores e são promissores alvos terapêuticos. No entanto, há poucas evidências da importância da metilação diferencial e do papel de enzimas reguladoras epigenéticas na tumorigênese de ST-ZFTA. O objetivo deste estudo foi identificar genes diferencialmente metilados com potencial valor prognóstico e entender as vias e processos biológicos envolvidos na progressão tumoral de EPNs ST-ZFTA. Foi explorada a distribuição de CpGs entre ST-ZFTA e ST-YAP1, com ST-ZFTA apresentando perfil hipermetilado em comparação ao ST-YAP1. A expressão gênica de DNA metiltransferases (DNMTs) foi analisada, com DNMT1 e DNMT3A apresentando maior expressão gênica no subgrupo ST-ZFTA em comparação aos subgrupos ST-YAP1 e FPA. Análises in silico identificaram biomarcadores candidatos hipermetilados/hipoexpressos e hipometilados/hiperexpressos entre ST-ZFTA vs. STYAP1. A inibição farmacológica de DNMT usando 5-Aza e Zeb resultou em efeitos antiproliferativos, pró-apoptóticos e parada do ciclo celular (G2/M) na linhagem celular BXD-1425 (ST-ZFTA). Além disso, o RNA-Seq após o tratamento com 5-Aza evidenciou genes candidatos que apresentaram reversão transcricional após a desmetilação. A expressão de dezoito HDACs também foi analisada, sendo que EPNs ST-ZFTA apresentaram maior expressão gênica de HDAC4 em comparação a ST-YAP1 e FPA e baixa expressão de HDAC7 e SIRT2. Nossos resultados identificaram genes candidatos controlados por metilação de DNA comvalores prognósticos, além de novos insights sobre HDAC4 em ST-ZFTA. No entanto, mais estudos são necessários para validar os genes candidatos regulados pela metilação do DNA e o envolvimento de HDAC4 isolado ou em combinação com metilação de DNA na carcinogênese de ST-ZFTA
• Imprenta:
  • Publisher place: Ribeirão Preto
  • Date published: 2023
• Data da defesa: 22.05.2023

Informações sobre o DOI: 10.11606/T.17.2023.tde-08082023-141956 (Fonte: oaDOI API)
• Este periódico é de acesso aberto
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• Cor do Acesso Aberto: gold
• Licença: cc-by-nc-sa

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• ABNT

  SOUSA, Graziella Ribeiro de. Identificação de potenciais biomarcadores epigenéticos em ependimomas supratentoriais. 2023. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2023. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-08082023-141956/. Acesso em: 01 jun. 2024.

• APA

  Sousa, G. R. de. (2023). Identificação de potenciais biomarcadores epigenéticos em ependimomas supratentoriais (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-08082023-141956/

• NLM

  Sousa GR de. Identificação de potenciais biomarcadores epigenéticos em ependimomas supratentoriais [Internet]. 2023 ;[citado 2024 jun. 01 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-08082023-141956/

• Vancouver

  Sousa GR de. Identificação de potenciais biomarcadores epigenéticos em ependimomas supratentoriais [Internet]. 2023 ;[citado 2024 jun. 01 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-08082023-141956/

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